Tóm lược quy trình:

- DN khai báo tờ khai trên hệ thống khai báo điện tử của DN và gửi đến cơ quan
HQ qua mạng internet.
- Cơ quan HQ tiếp nhận thông tin khai báo của DN, kiểm tra và phân luồng tờ
khai trên hệ thống XLDL TQĐT và gửi về cho DN cũng qua mạng internet.
- Trên cơ sở thông tin phản hồi từ cơ quan HQ, DN in tờ khai từ hệ thống khai
báo điện tử của DN; ký tên, đóng dấu và làm các thủ tục tiếp theo. Luồng xanh: Sau
khi đã làm thủ tục xuất kho, bãi, DN mang tờ khai đến Đội Giám sát tại Chi cục HQCK
để làm thủ tục thông quan. Luồng vàng: DN mang bộ hồ sơ đến Đội Thông quan Chi
cục HQĐT để xuất trình. Sau khi kiểm tra hồ sơ, nhân viên HQ tiếp nhận, in phiếu
kiểm tra chứng từ giấy, giao cho DN 01 bản. Chi cục HQĐT duyệt thông quan trên hệ
thống XLDL TQĐT. DN mang tờ khai đến Đội Giám sát tại Chi cục HQCK để làm thủ
tục thông quan như hàng luồng xanh (trừ trường hợp hàng phải kiểm tra thực tế thì
thực hiện như đối với hàng luồng đỏ). Luồng đỏ: DN mang bộ hồ sơ đến Đội Thông
quan Chi cục HQĐT để xuất trình. Sau khi kiểm tra hồ sơ, nhân viên tiếp nhận, in
phiếu kiểm tra chứng từ giấy, niêm phong bộ hồ sơ giao cho DN chuyển đến Đội Thủ
tục tại Chi cục HQCK. DN mang bộ hồ sơ đến Đội Thủ tục tại Chi cục HQCK để kiểm
tra hàng. Sau khi kiểm tra hàng xong, nhân viên HQ kiểm hóa sẽ nhập kết quả vào hệ
thống XLDL TQĐT, in phiếu ghi kết quả kiểm tra, giao cho DN 01 bản. Chi cục
HQĐT căn cứ kết quả kiểm tra của Chi cục HQCK, sẽ kiểm tra hồ sơ sau kiểm hóa,
duyệt thông quan hàng hóa trên hệ thống XLDLTQĐT. DN mang tờ khai đến Đội GS
tại Chi cục HQCK để làm thủ tục thông quan hàng hóa. (Chi tiết quy trình xem ở mục
6, phụ lục 2, trang 91).