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Trabajo Prctico Especial de Seales

y Sistemas:
Deteccin automtica del complejo
QRS en Tiempo Real
Segundo Cuatrimestre de 2010

Objetivo
Elpresenteproyectoespecialtienecomoobjetivohacerusodetcnicasyherramientasdeanlisisde
seales,aplicndolasaunproblemaprctico,deutilidadreal.Enconcreto,seproponerealizarun
anlisisydeteccindeeventosbsicosdeunasealdeElectrocardiograma(ECG)deunregistrode
largaduracin.Paraelloseutilizarnlastcnicasyherramientasdeanlisisqueseestudiaron
previamenteeneldesarrollodelacursada.Estasherramientassern:
Espectrodecortotiempodeunaseal.Anlisisconjuntodeelementosdetiempoy
frecuencia.
Diseodefiltrosdigitales.Especificacionesderivadasdelaaplicacin.

Requisitos para la aprobacin:


Elproyectoespecialtendrunafechalmitedevencimientoysuevaluacinestestablecidaenel
calendariodelamateria,daenelcualelalumnodeberpresentarseindefectiblementeconel
informedelproyectoenformaimpresa.Habrunrangodefechasanterioralafechadefinitivade
entregaenelcualelalumnopodrhacerunapreentregadelproyectoespecialenversin
electrnica,pdfsolamente,en.http://campus.fi.uba.ar/.Duranteeserangodefechaseldocente
puedeaconsejaralalumnolarevisindeciertospuntosenelproyecto.Luegodelcierredelperodo
depreentrega,sehabilitarunperododeentregadefinitiva,dondeelalumnodebedepositarsu
versinpdfdelinformeylosalgoritmoscorrespondientes.Luegodelvencimientodelperodode
entregadefinitivo(anterioralaevaluacindelproyectoespecialenunosdas),noseadmitirnms
entregasyelalumnoquenocumplaesterequisitoquedarlibre.Luegoeldocentedecadacurso
evaluarelmismoeneltiempoyformautilizandolaversinelectrnicaolaimpresa,yasentarenla
versinimpresalanotadelproyecto.Lamodalidaddelaevaluacinserealizarsegneldocentelo
creaconveniente(oral,escrita,eldadelaentrega,otroda,etc.),demododeasegurarel
conocimientodeltemadesarrolladoylarealizacinindividualdeltrabajoporpartedelalumno.El
trabajosolopodrserpresentadoyevaluadoenelcursoenelcualelalumnosehallainscripto.
Laevaluacinfinalpuedeincluirpreguntassobre:
temsparticularessobrelosejerciciosdeestaguaysuimplementacinenMatlab.
Conceptostericosnecesariospararealizarlosejercicios.

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Puederequerirsetambinalalumnoqueimplementealgunodelosejerciciossimilaresenla
computadoraenelmomentodelaevaluacin.Porlotantoelalumnodebepresentarseeldadela
evaluacincon:
Estagua.
Lassolucionesalosproblemasplanteados:Cuandoelproblemarequierauna
implementacin,lamismadebeestaradecuadamentedescriptaydebidamentejustificada.Es
decir,siesnecesariojustificacinterica,stadebeestardesarrollada.Sisepideuna
implementacinprcticalamismadebeestaradecuadamentedocumentadademodoqueel
docentepuedaconstatarquelasespecificacionesrequeridassecumplen.Estoincluyela
presentacindelprogramadeMATLAButilizado,ylosgrficosnecesariosparamostrarlos
resultadosobtenidosenformatoelectrnicoeimpresos.Sesugierequeelformatoelectrnico
nodependadequefuncioneinternetparapoderverse,paraevitarinconvenientes.Todoslos
grficosdeberntenerttulo,comentariosenambosejessobrelaunidadarepresentaryeleje
deabscisasdebeestarenunidadesdetiempoofrecuenciasegncorresponda.

Nota del trabajo prctico especial


Elproyectoespecialseaprobarcon60puntossobre100.Lanotafinaldecursadasedetermina
ponderandolanotadelparcial(Npar)conlanotadelproyectoespecial(Npe)delsiguientemodo:
Cur=0.6*Npar+0,4*Npe
Lanotadecursada(Cur)debesermayorque60puntosparaaprobarlacursada.Laaprobacindel
ProyectoEspecialtambinescondicinnecesariaparalaaprobacindelacursada.Cadaejercicio
totalmentebienresueltotendrelpuntajequefiguraenlapartedeejercitacin.Cadadocente
evaluardeacuerdoaesagrillaeltrabajorealizado.

Introduccin
Elelectrocardiograma(enadelanteECG),esunarepresentacingrficadelaactividadelctricadel
coraznqueofreceinformacinacercadelestadodelmsculocardaco.Estarepresentacinconsiste
enunalneadebasesobrelacualseobservandeflexionesyondas.Elorigenseencuentraenlas
clulasdelmsculocardacoqueposeenlapropiedadquecuandoselasexcitadesdeelexterior
generanunflujodeionesqumicosatravsdeella,comosucedecontodaslasclulasnerviosasy
motoras.Peroadiferenciadelasclulasnerviosas,lasclulasmotorascuandoseexcitanalmismo
tiemposecontraen,porloscomponentesparticularesquecontieneelinteriordedichasclulas.Las
clulasdelcorazn,adiferenciadelrestodelasclulasmotoras,tienenlapropiedaddequedespus
deuntiempodeproducidaunacontraccin,lasclulasserelajanyvuelvenaexcitarse
automticamentesinnecesidaddequealgnestmuloocurra.Cadaintercambioinicoentrelas
paredesdelaclula(despolarizacinasociadaaunacontraccin)puedepensarsecomoundipolo
elctricoquecambiadepolaridadenfuncindeltiempo.Simuchasclulascardacassecontraenal
mismotiempoydemanerasincronizada,elefectoconjuntodetodosesosdipolosquevaranenel
tiemposesuman,dandocomoresultadounatensinvariablequepuedesermedidadesdeelexterior
conuncircuitoamplificadordetensin.Paraqueelfuncionamientodelcoraznseaposible,cada
clulacardacadebecontraersecoordinadamenterespectodelresto.Elllamadocircuitoelctricodel
coraznhaceposibleesto.Locomponenunapartedelasclulasdelmsculocardacoquetienenla
particularidaddesermsfcilmenteexcitablesqueelresto.Sufuncinespropagarlosimpulsos
elctricoshaciatodoslossectoresdelmsculocardacodemodoqueelcorazncumplasufuncin
debombearsangre.Elcoraznestcompuestodedospartescasisimtricas,aisladasentres.Cada
unadeellasestcompuestaasuvezpordoscmarasinterconectadas:unaaurculayunventrculo.
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Lapartederechadelcoraznbombealasangrequevienedelcuerpohacialospulmones,mientras
quelaizquierdabombealasangreyaoxigenadaquevienedelospulmoneshaciaelcuerpo
nuevamente.EnlaFIGURA1sepuedeobservarunesquemadelaestructuraanatmicadelcorazn,
ysucircuitodeconduccin
Elventrculoesrealmentelabombaimpulsoradelasangredecadaladodelcorazn.Lasaurculas
cumplenlafuncindecmaradeprellenado,yporlotantodebenllenarseunpocoantesqueel
ventrculocorrespondiente.Cuandotodaslasclulascardacasdeunacavidadsecontraenalmismo
tiempo,esacmaraexpulsalasangrequecontiene.Aesteeventoseloconocecomosstole.En
cambiocuandoserelajalasangreentraendichacmara,eventoqueseconocecomodistole.De
estemodounlatidoestcompuestoporunasecuenciasstoleauriculardistoleventricular
simultneas,dondelasangreesexpulsadadelaaurculamientrassevallenandoelventrculo,
seguidoacontinuacindeunperodomslargodesstoleventriculardistoleauricular.Ladinmica
deestasecuenciaescomoseescuchaconunestetoscopio:dosgolpesseguidos,elprimero
correspondealacontraccinauricular,mientrasqueelsegundomaslargocorrespondeala
contraccinventricular.Enverdadlossonidosescuchadosduranteunlatidosedebenalasvlvulas
delasalidadecadacmara.

Figura 1: Esquema de la vista y corte frontal del corazn.

Elresponsabledeiniciarellatidocardacoesunapequeafraccindetejidoespecializadoinmerso
enlapareddelaaurculaderecha,elnodosinusal,tambinllamadomarcapasos.Alleseconjuntode
clulasseautoexcitanautomticamentecadaundeterminadotiempo,quedarlafrecuencia
cardaca.Estemarcapasostieneunasramificacionesmsdentrodelaaurcula,yalcontraerse
empiezaunasecuenciadecontraccionessucesivasquevandesplazndoseportodalaaurcula
produciendolasstoleauricular.Comotodavalassealesnoalcanzaronalventrculosteestar
relajndosealmismotiempo,enladistoleventricular.Despus,lacontraccinsepropagaalaparte
inferiordelaaurculaderechaporlosllamadosfascculosinternodalesalcanzandootronodollamado
auriculoventricular.Estenodocumplecasilafuncindeunsegundomarcapasosoelemento
sincronizador:cuandotodaslassealesconcurrenal,empiezalapropagacindelassealesa
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travsdelventrculo,enlasstoleventricular.Almismotiempolaaurculaempezarsudistole,para
poderllenarsedesangreparaelsiguientebombeo.Loshacesauriculoventriculares,agrupadosenla
paredinteriordelcoraznseramificanhaciatodoelventrculo,conduciendoelimpulsodesdeeste
nodoatodoelventrculo.Deestemodoeldesplazamientoenelespaciodelasecuenciade
despolarizacionesdetodaslasclulasdelcaminoelctricopuedenserpensadoscomoungran
dipoloelctricoquesemueveenelespacio.Elelectrocardiogramaeselregistrodeesemovimiento
elctrico,queesmedidocomounadiferenciadetensinentredoselectrodos,conectadospor
ejemploentrelosdosbrazosdeunapersona.Comoelmovimientodeesedipoloelctricoesentres
dimensionessernnecesariosporlomenos3medicionesenlastresdireccionescartesianaspara
componertodoelrecorridodelvectorelctrico.Cadaunodeestosregistros,queenlenguajemdico
seconocencomoderivaciones,eslaproyeccindelrecorridodeldipoloelctricoenunadada
direccin.
EnlaFigura2semuestraunesquemadelasetapasdeunlatido,conlascorrespondientes
evolucionesdelassealesdepresin,fonocardiograma(PCG,delinglsphonocardiogram)oseal
audibledelcorazn,yelECG.
Sstole
ventricular

Presin

Sstole auricular

Figura 2: Esquema del funcionamiento del corazn en el transcurso de un latido.

DescripcindeunasealdeECG
Lasporcionesdelelectrocardiogramaentrelasdeflexionessedenominansegmentos,ylasdistancias
entreondassedenominanintervalos.Cadaunadeestasporcionesdelasealsecorrespondencon
unodeloseventosdellatidoanteriormentedescriptos,yloscualessedetallanacontinuacin:
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OndaP.Representaladespolarizacindelaaurcula.Suduracinesmenorde100msysuvoltaje
noexcedelos2,5mV.
IntervaloPR:Muestraelperododeinactividaelctricacorrespondientealretrasofisiolgicoquesufre
elestmuloenelnodoauriculoventricular.Suduracindebeestarcomprendidaentrelos120y
200ms.
ComplejoQRS.Representaladespolarizacindelosventrculos.EstformadoporlasondasQ,Ry
S.EstaporcindelasealeslademayoramplituddetodoelECGnormal.Suduracinesde80a
100ms.
SegmentoST:ComprendedesdeelfinaldelcomplejoQRShastaeliniciodelaondaT.
OndaT.Representalarepolarizacindelosventrculos.
IntervaloQT:ComprendedesdeeliniciodelcomplejoQRShastaelfinaldelaondaTyrepresentala
despolarizacinyrepolarizacinventricular.Suduracinestarentre320y400ms.
EnlaFigura3,sepresentaunesquemadeunciclocaractersticodeunECGnormal.

Figura 3: Esquema de un ciclo caracterstico de un ECG normal.

Descripcin de las seales.


Unodelasprincipalesreasdeintersdelprocesamientodeestetipodesealeseselanlisis
automticodeunelectrocardiogramaHolter.Estetipodeestudiocorrespondeaunregistro
electrocardiogrficocontinuode2448horas.Enestoscasoslospacientesllevanpuestoun
registradorporttilcondosderivacionesduranteeselapso.Estasealpermiteunmayorcontroldela
evolucindeunpacientealolargodeunperodorelativamentegrandedetiempo,evitandolafaltade
informacinqueapareceenunelectrocardiogramanormaldebidoasucortaduracin.Seha
demostradosuutilidadenladocumentacindearritmiasyenlostrastornosdelaconduccindel
impulsocardaco.Mediantelacorrelacindelossntomasdelospacientesylosregistros
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electrocardiogrficospuedehallarseunaexplicacinasntomascomomareos,sncopesy
palpitaciones.EsimportanteresaltarquelasealHolterestformadaporcentenaresdemilesde
ondascadaunacorrespondienteaunlatido,locualhaceimposibleelexamendetalladodetodasy
cadaunadeellasmedianteinspeccinvisual.Loidealseraqueunanlisisautomticoseacapazde
aislarlasporcionesdeintersdelregistro,paraluegoseranalizadasporlosmdicos.
Lassealesqueutilizaremosenesteensayoconstituyenpartedeunabasededatosdisponibleenel
sitiodelMITDB:TheMassachusettsInstituteofTechnologyBethIsraelHospitalArrhythmia
Database.Estetipodebasesdedatostienenporobjetorealizarinvestigacionessobredichasseales
porlacomunidadinternacional,ycontrastarlosresultadosobtenidosdeunamaneraobjetiva.Para
ello,lassealesquesepublicanademsdecontenerunaomsderivacionesdelaseal
electrocardiogrfica,vienenacompaadasdeotrostiposdedatos,comoporejemploanotaciones
validadosporobservacinmanualdelaposicindecadalatido,unaclasificacindecadalatido,etc.
Nosotrostrabajaremosconunasealde30minutosdeunaderivacin.LasealdeECGse
encuentranenformatobinariodematlab,enelarchivo103m.mat,suministradoporlactedraenlos
sitioswebutilizadoshabitualmente(campus.fi.uba.ar,
http://materias.fi.uba.ar/6607/adicional/adicional.html).Adicionalmente,sedisponedelarchivode
textoinfo103m.txtconinformacinsobrelasealycmofueadquirida,talcomoladerivacinala
cualcorresponde,longituddelaseal,frecuenciademuestreo,entreotros.Aestasealselehan
marcadomanualmenteloscomplejosQRS.Estainformacinseencuentraenelarchivodetexto
marcas103m.txt,dondecadaelementoindicaelinstantetemporal,ennmerodemuestras,dela
ocurrenciadeuncomplejoQRS.Lainformacincontenidaenestearchivoserusadacomo
referenciaparaevaluareldesempeodelosmtodosautomticosdeetiquetadodeeventosQRS.

Ejercicios (20%)
1. UbicarenformamanualloscomplejosQRS,determinandolossegmentosquecomponenla
onda.
2. MuestrelascaractersticasenfrecuenciadelcomplejoQRS,paraelloobtengaelespectrocon
distintostiposdeventanasylongitudesdelamisma,expliquelasventajasydesventajasde
estasvariantes.
3. Realiceunespectrogramadelasealdeelectrocardiograma,quepermitavisualizarlas
caractersticasenfrecuenciadelaondaQRS.Implementarelespectrogramademodode
observarlascaractersticasdefrecuenciadescriptasenelpunto2.
4. DeterminequtipoderuidosestnpresentesenlasealdeECG.Enprimerlugardescriba
losruidosestacionariosqueencuentra,utilizandotantogrficosentiempocomoel
espectrograma.LuegodeterminequporcionesdesealdeECGtienensumadosruidosno
estacionarios.Expliquelasposiblesfuentesdecadaruido.

Preprocesamiento de la seal
Comopodemosver,lasealtienemsinformacindelanecesariaparaladeteccindecomplejos
QRS.Adems,puedeestarsumergidaenruidos.Parapodertrabajarenladeteccindeeventosde
inters,elprimerpasoeseliminaroatenuartodalainformacinquenoseatilointerfieraconesta
tarea.Aestatarealedamoselnombrepreprocesamiento,yconsistirenlossiguientespasos:

Paso1:Paraatenuarelruidopresenteenlasealserealizaunfiltradopasabanda.Utilizarun
filtropasaaltosencascadaconunfiltropasabajos,confuncionesdetransferenciasdadaspor:

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Elfiltropasabandamejoralarelacinseal/ruidoyestopermiteutilizarbajosumbralesde
deteccinyporlotantoaumentalasensibilidad.

Paso2:Realizarladerivadadelaseal,conelfindeencontrarlosmximosenloscomplejos
QRS.Implementarladiferenciacindelasealmediantelasiguienteecuacinendiferencias.

Paso3:Luegodeladiferenciacinlasealeselevadaalcuadradopuntoapunto.

Paso4:IntegracindelasealsobreunaventanadeslizantedelongitudN,segnlaexpresin:

LacorrectaeleccindeNayudaraunamejorperformancedeldetector.Luegosehallanlos
mximoslocales,opicos,comoposiblesmarcadoresdecomplejosQRS.

Deteccin automtica de latidos


Paradeterminareltiempodecadalatido,lomsprcticoesdeterminarlaposicindelcomplejoQRS
decadaciclo.Dichaporcindesealtienecaractersticasparticularesdefrecuenciaytiempoquela
hacendistinguibledelresto.
Se han presentado diferentes algoritmos para realizar esta tarea en forma automtica . En este
trabajoutilizaremosunavariantedelmtododesarrolladoporPanyTompkins ,conocido bajoel
nombrede GoldStandard,elcualesunreferenteenestatarea.Acontinuacindesarrollaremos
brevementedichoalgoritmo.

Algoritmo de deteccin
Luegodelpreprocesamientodelasealcomoseexplicenlaseccinanterior,seprocederala
implementacindelalgoritmo.Elalgoritmodedeteccinsepuederesumiren:
1. Inicializacin:Luegodeltransitorioinicial,tomardossegundosdesealparainicializarlos
umbrales:Umbral_sealyUmbral_ruido;yvariablesanexasNivel_sealyNivel_ruido;dela
formasiguiente:
a. Sipico_maxeselmayordelosmximoslocales,entonces:
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Umbral_seal=Nivel_seal=pico_max
b. Sipico_mineselmenordelosmximoslocales,entonces:
Umbral_ruido=Nivel_ruido=pico_min
2. Luego,paracadamuestradelaseal,ysinoestamosenunperodorefractario,hacer:
a. Silamuestraactualesunpico,peronosuperaelumbraldelasealUmbral_seal,
entoncesactualizamoslosumbralesdelasiguienteforma:
Umbral_seal=Nivel_ruido+0.25(Nivel_sealNivel_ruido)
Umbral_ruido=0.5Umbral_seal
b. Sisuperaelumbralseal,entoncestenemosuncandidatoacomplejoQRS,y
hacemos:
i. FijamoslamuestraactualcomouncandidatodecomplejoQRS.
ii. Inicializamoselperodorefractariode200ms.
iii. Estimamoselvalordelpromediodelosltimos8intervalosRR,RR_avg_8,
comoladistanciaentrelosltimoscandidatosdecomplejoQRS.
iv. Estimamoselvalordelpromediodelosltimos8intervalosRRaceptables,
RR_avg_good.UnintervaloRRaceptable,RR_good,esaquelquecumplecon:
0.92RR_avg_good<RR_good<1.16RR_avg_good
ParainicializarRR_avg_good,sepuedetomarcomoelprimervalorde
RR_avg_8.
v. EstimarelumbralparalosvaloresdelosintervalosRR,Umbral_RR,como:
Umbral_RR=1.66RR_avg_good
vi. SielvaloractualdeintervaloRResmenorqueelumbralUmbral_RR
1. Entoncesactualizarelnivelsealcomo:
Nivel_seal_nuevo=0.125Valor_pico_actual+0.875Nivel_seal_anterior
2. Sino,podemoshaberperdidouncomplejoQRS.Enestecaso,
procedemosabuscarelanteriormximolocalqueseencuentre
despusdelltimopicovalidoencontrado,yqueseasuperioralumbral
deruidoUmbral_ruido,yhacemos:
a. Fijamoselpicoencontradocomouncandidatodecomplejo
QRS.
b. Inicializamoselperodorefractariode200ms.
c. Actualizamoselniveldesealcomo:
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Nivel_seal_nuevo=0.25Valor_pico_actual+0.75Nivel_seal_anterior

Ejercicios (80%)
5. Paracadaunodelosfiltrosutilizadosenelpreprocesamientodelaseal,determineenforma
analticasudiagramadepolosyceros,respuestaenfrecuencia,yrespuestaalimpulso.
Determineademscmoharaparacalcularlarespuestaenfrecuenciaylarespuestaal
impulsoutilizandofuncionesdeMatlabcomofreqz,yfilter.Grafiquetodasestasmagnitudes
anteriormentemencionadasyrelacinelasconsufuncinenelpreprocesamiento.Puede
utilizarlafuncinzplaneparadibujareldiagramadepolosyceros.
6. CalcularygraficarlasalidadeestosfiltrosparasealdeECGproporcionada.Observequeen
elcasodelfiltroHLesposiblerealizarelfiltradoIIRounaversinFIRdelmismo.Discutala
ventajadeambasimplementaciones.Calculeelretardodecadaetapa,enformaanalticay
medianteMatlab.Expliqueporquestefiltroestfuncionandocomounnotch,yqu
frecuenciasestanulando.Esimportantelaanulacindeestasfrecuenciasparael
procesamiento?
7. RealiceladeteccindelcomplejoQRSconelmtodopropuestoycontrasteelresultado
obtenidoconlaposicindeloslatidosmarcadosenelarchivomarcas103m.txt.Puedeutilizar
elprogramadeMatlabqrs_detection.m.Evaluarlaperformancecontandolacantidadde
falsospositivosyfalsosnegativos.Unfalsopositivoesunamarcaquenosecorrespondecon
uncomplejoQRS.Estotambinpuedetomarsecomolainsercinerrneadeunamarcade
complejoQRS.UnfalsonegativoesnomarcaruncomplejoQRS.
8. AdicionarruidoblancoalasealdeECG,paraobtenersealesconunarelacinsealruido
de30dB,20dBy10dB,respectivamente.Paraellosecuentaconunasealderuidoblanco
white.mat,quedebesersumadaalasealoriginalconunaamplituddistintaparacadaunode
loscasosderelacindesealaruidopedida.Evaleeldesempeodeldetectorconestas
nuevasseales.
9. RealiceelespectrogramadelasealsalidadeltercerfiltroHdyrelacionedichogrficoconlas
zonasdemayorerrordedetecciones.PropongaalgunamodificacinenlosfiltrosHL,HHoHd
quemejorenelrendimientobasadoenlasobservacionesanteriores.
10.Realicetodoelprocesamientoanteriorperoconlassealesremuestreadasa200Hzenlugar
de360Hz.Describaelprocesamientodiscretonecesarioparacambiarlafrecuenciade
muestreoenformadiscreta,ydeterminelanuevaformaquedebentenerlosfiltrosHL,HHyHd
paracumplirconidnticosrequerimientosdeprocesamientoqueenelcasodelafrecuencia
demuestreooriginal.Diseeelfiltroantialiasingutilizandoelmtododeventaneo,yjustifique
sunecesidad.

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Bibliografa
[1]

J.PanandW.J.Tompkins,ArealtimeQRSdetectionalgorithm.InIEEETrans.Biomed.
Eng.Vol.32(3),pp.230236.1985.

[2]

F.Portet,A.I.HernndezandG.Carrault,EvaluationofrealtimeQRSdetectionalgorithmsin
variablecontexts.InMedical&biologicalengineering&computing.Vol.43(3),pp.381387.
2005.

[3]

I.Christov,RealtimeelectrocardiogramQRSdetectionusingcombinedadaptivethreshold,
InBioMedicalEngineeringOnLine3:28.2004.

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