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GENTICA

BACTERIANA
Ph.D. Germn Hermosilla D.
Programa de Microbiologa y Micologa
ICBM, Facultad de Medicina, Universidad de Chile

INFORMACIN GENTICA EN
BACTERIAS
CROMOSOIDE BACTERIANO
ELEMENTOS EXTRACROMOSMICOS
Plsmidos
Transposones
Fagos
Integrones y Cassettes Gnicos
Islas Genmicas

CROMOSOIDE BACTERIANO
DNA de doble hebra circular, de
alto peso molecular (4,6x106 pb en
E. coli).

Molcula altamente compactada


Nucleoide (FIS, H-NS, HU e IHF).
Replicacin del DNA acoplada a la
divisin celular.

5,8x105 a 107 pb

TAMAO
CROMOSOIDE
BACTERIANO
Mycoplasma genitalium
580.073 pb of ADN (codifica para 517 genes)

el ms pequeo?

Tamao genmico y nmero de genes en


bacterias y arqueas (Gregory and DeSalle, 2005).

5,8x105

107

pb

TAMAO
CROMOSOIDE
BACTERIANO

Tamao genmico en bacterias con diferentes


estilos de vida

159.662 pb (189 genes)


Carsonella (dark blue) vive dentro de la clula,
alrededor del ncleo (light blue) de un insecto.
Nakabachi et al. (2006).

ORGANIZACIN GENMICA
Cromosoides circulares

Escherichia coli
Rhodobacter sphaeroides
Brucella melitensis
Leptospira interrogans
Rhizobium meliloti
Burkholderia cepacia

1
2
2
2
3
3

Cromosoides lineales

Borrelia burgdorferi
Streptomyces lividans
Rhodococcus fascians

1
1
1

Cromosoides circulares
y lineales

Agrobacterium tumefaciens

1+1

ESTRUCTURA FSICA DE LA DOBLE HELICE

COMPACTACIN DEL DNA

SOBRE-ENROLLAMIENTO EN E. coli
Protenas asociadas al ADN
Protena

Subunidad

FIS
H-NS
HU

2
6

IHF

Gene
fis
hns
hupB ()
hupA ()
himA ()
himD ()

Dominio sobre-enrollado (#50)

Nucleoide

1 mm

REPLICACIN DEL ADN BACTERIANO

Replicacin del ADN est


acoplado a la divisin celular

Origen de Replicacin
El origen de replicacin en E. coli es una secuencia de 245 pb que contiene una
secuencia de 13 pb, repetida tres veces en tndem. Adems, esta regin contiene cuatro
zonas de unin a la protena Dna A que se encarga de separar las hlices para
comenzar la replicacin

Burbuja

Letra griega

Experimento de pulso y caza

La replicacin es bidireccional

Cmo la replicacin del ADN est acoplado a la


divisin celular?
Regulacin de la sntesis de DnaA.
Dam metilasa y SeqA regulan el inicio de la
replicacin por secuestro de la regin OriC.
(OriC y regin promotora de del gen dnaA son ricas en sitios dam
GATC/CTAG)
(11 sitios dam en OriC. La hemimetilacin inhibe el inicio de la replicacin)

INFORMACIN GENTICA EN
BACTERIAS
ELEMENTOS EXTRACROMOSMICOS
Plsmidos
Transposones
Fagos
Integrones y Cassettes Gnicos
Islas Genmicas

PLSMIDOS
Molculas
de
ADN
extracromosmico

circular

Origen de replicacin propio (ORI),


determina el rango de hospederos
Tamao molecular 1kb a 200kb

Nmero de copias por clula es variable


Transportan informacin gentica no
esencial
Pueden portar genes de virulencia o
resistencia a antibiticos
Grupos
de
incompatibilidad:
Replicacin y Particin. Ej. IncW, IncP
e IncN
Plsmidos Auto-transferibles: Genes tra
(Pilina, helicasa, primasa, chaperonas, etc)

Plsmidos Movilizables: Genes mob, Ori T

TRANSPOSONES
Elemento de Insercin
(IS 1)

Transposasa

Transposn Compuesto
(Tn 5)

Transposasa

Transposn NO-Compuesto
(Tn 3)

IS50L

IS50R
Km

Transposasa

(Resistencia a kanamicina)

Transposasa

Resolvasa

Ap
(Resistencia a ampicilina)

No se reproducen en forma autnoma


Elementos genticos mviles (0.75kb a 10 kb) Transposicin
Recombinacin no homloga
Transposicin:
Cortar y Pegar (IS y transposones compuestos)
Replicativa (transposones no-compuestos con resolvasa)

INTEGRONES Y CASETES GNICOS

FAGOS
Partculas
bacterias

virales

que

infectan

Genoma ADN o ARN, encapsulado


por protenas
Adsorcin: unin a receptores
especficos de la pared celular
Pueden establecer un ciclo ltico
o lisognico
Para
integrarse
reconocen
secuencias especficas en el
genoma bacteriano

TRANSFERENCIA GENTICA
HORIZONTAL
TRANSFORMACIN

TRANSDUCCIN

CONJUGACIN

TRANSFORMACIN

PLASMIDOS:

Plsmidos R
Plsmidos col
Plsmidos de virulencia
Plsmidos metablicos

Shigella, E. coli
Bacteriocina E1
Shigella 200 Kb
Yersinia 70 Kb (Yops)
P. putida (Tol)

FRAGMENTOS DE DNA LIBRES

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TRANSDUCCIN
Generalizada: P1 y P22
Ciclo Lisognico
, P1 y P4

Especializada:

Ciclo Ltico
(T4 y T7)

CONJUGACIN
PLSMIDOS AUTO-TRANSFERIBLES : Factor F y pKM101
TRANSPOSONES CONJUGATIVOS

: Tn916 (E. faecalis)

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TRANSFERENCIA GENTICA
EN EL AMBIENTE

FENOTIPOS ADQUIRIDOS
EN EL AMBIENTE

Resistencia a metales pesados


Resistencia a antibiticos
Nuevas capacidades
metablicas
Adquisicin factores de
virulencia

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TRANSFERENCIA ENTRE REINOS

Integrn
(Resistencia Antibitico)

pR7S1 (IncP)
Plsmido Promiscuo

Tn5090

BACTERIA

LEVADURA

TRANSFERENCIA ENTRE REINOS


Bacterias

Bacterias

Bacterias

Archea

Bacterias

Eucariontes

Eucariontes

Bacterias

Plsmidos autotranferibles
promiscuos
IncW

Gram (-)

Gram (+)

IncP (RP4)

Gram (-)

Cianobacterias

IncV

Gram (-)

Plantas

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ISLAS GENMICAS

Flanqueada por secuencias repetidas directas


Contiene un gen para movilidad, como integrasa o transposasa
Elementos relacionadas a secuencias de insercin y transposones
Regiones con contenido G+C diferente al genoma
Uso de codones diferentes
Abundancia relativa de dinucleotidos o tetranucletidos
Prximos a genes de tRNA
Estabilidad de la regin (prdida y/o adquisicin)

ISLAS DE PATOGENICIDAD
Bacteria
Adquisicin de
bloques de genes

Elemento Gentico
Mvil

Presence in pathogenic strains, and absence (or sporadic


distribution) in less pathogenic strains of the same or a
related species
Carriage of (often many) virulence genes (toxins, adhesins,
invasins, secretion systems (type III, type IV) and their
substrates (effectors)
Expression of acquired genes is under the control of
chromosomal or PAI-encoded regulators; interaction of the
PAI with the genome is required. E.g.: expression of
invasion genes within the Salmonella SPI-1 is governed by
the PhoP/PhoQ two-component system outside of SPI-1.

Seleccin

Mayor Fitness
(adecuacin)
Especializacin
AMBIENTE

Adecuacin
ecolgica

HOSPEDERO

Interaccin
Saproftica

Simbiosis

Patogenicidad

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ISLAS DE PATOGENICIDAD EN E. coli K12


UPEC
UPEC

Sepsis E. coli
UPEC

EHEC
UPEC
EPEC/EHEC
Shigella (SHI-2)
Salmonella (SPI-3)

Salmonella (SPI-5)
EHEC

Salmonella (SPI-2)
UPEC
UPEC
Sepsis E. coli
Meningitis E. coli
EHEC

EHEC
UPEC
EHEC

TGH y PATOGENICIDAD DE Escherichia coli

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Distribucin de ADN codificante de


protena adquirido por TGH

plsmidos, transposones, fagos


mecanismo desconocido

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