CLASE 24

MUTACION DEL DNA Y TRADUCCION DEL DNA

Dentro de las mutaciones, tenemos que el mas
comn es la desanimacin de la citosina, la citocina
se transforma en uracilo, un par g-c se transforma en
un par t-a, eso trae consecuencias degenerativas, si
esta mutacin ocurre en un lugar importante, un gen
que controla la expresin. Esto es una posible causa
del cncer, pero la probabilidad que ocurra es muy
baja, ya que la clula tiene una maquinaria
importante para reparar el DNA.
Pregunta: si yo tengo esa mutacin en mi par de
bases, mis hijos tambin la tendran?
Respuesta: eso depende, si la mutacin esta en las
clulas germinales, yo creo que si.
La DNA polimerasa puede cometer varios tipos de
errores, uno de esos es equivocarse en poner una base por otra. Tambin puede ocurrir que ponga bases de mas o
bases de menos, esto ocurre cuando hay muchas bases iguales, por ejemplo muchas A, lo que ocurre es un
deslizamiento, la polimerasa puede poner una t de mas o de menos.
La consecuencia directa de esto es que se corre toda la cadena, el marco de lectura, si esto ocurre en una zona no
codificante, no afecta mucho, pero si ocurre en una zona codificante, un exn, al desplazarse el marco de
lectura, los aa que se van agregando, no
corresponden a ese lugar. Lo que puede pasar con
esto es generar codones de trminos, y ah la
polimerasa terminara su trabajo en donde no debe.
DNA polimerasa, tiene capacidad de corregir lo que
va sintetizando, cuando agrega un base equivocada,
al tener su mecanismo de chequeo, revisa lo que va
poniendo, y retrocede sacando los nucletidos hasta
que llega a la base que esta mal, la saca, la
reemplaza por la base correcta, y sigue nuevamente
sintetizando.
Todas las especies no tienen ese mecanismo de
correccin, solo los animales superiores. Las
bacterias no tienen esa capacidad correctora, al igual
que los virus, esto permite que los virus muten, es
por eso que aun
no tenemos una vacuna contra el sida, los animales tenemos otros sistemas
para generara la viabilidad gentica, que es la reproduccin sexual, eso
quiere decir que no dependemos de las mutaciones para que nuestros hijos
sean distinto a nosotros.
El mecanismo de reparacin, esto es independiente de la capacidad
correctora de la DNA polimerasa, una vez ya pasada la polimerasa por esta
hebra, e hizo la sntesis mal (mutacin) y no se dio cuenta, hay otro
mecanismo en el que participan dos enzimas: una que saca la base
nitrogenada equivocada, quedando el enlace fosfodiester, y despus llega
otra enzima, rompiendo el enlace fosfodiester, sacando el fosfato con la
ribosa para que despus llegue la polimerasa, y rellene el pedazo que esta sin
nucletido, esto esta siempre pasando todo el tiempo, la polimerasa que
acta aqu es distinta a la que hizo la sntesis, es de otro tipo.
Cuando el DNA tiene un dao muy grande, por ejemplo cuando la clula es
sometida a radiacin, acta un sistema de reparacin, que reconoce el pedazo
entero de la cadena, lo corta la enzima ENDONUCLEASA (donde hay
muchas bases alteradas) y despus viene la polimerasa y rellena.
Gracias a que la cadena es doble hebra es posible que ocurran todos estaos
mecanismos de reparacin.

Drogas antivirales:
AZT: lo que pasa con esta droga, es que se parece a una T, lo que la diferencia es que en el carbono 3 en vez de
tener OH tiene un triple nitrgeno, entonces la DNA polimerasa viral cuando empieza a sintetizar la cadena, la
confunde con una T, eso permite que cuando se le quiera agregar otra base mas, no podr ya que no tiene con
que unirse el enlace fosfodiester (falta OH). La clave del AZT, es que solo la polimerasa viral la confunde, la de
nuestro organismo no la confunde. Igual han aparecido organismos resistentes a esta droga.
DDI: tambin acta contra el sida, este se parece a G, en vez de tener un OH, en el carbono 3, solo tiene un H y
acta de la misma manera que AZT, impidiendo la formacin del enlace fosfodiester.
Hay otra droga que es un inhibidor de la proteasa del virus, completan el coctel, de la triterapia contra el sida.
CAN CER:
La base radica en la sntesis del DNA, la dos drogas mas
comunes son: Fluoruracilo: es un uracilo con un flor, y
la metotrexato, ambas se ocupan para la quimioterapia.
Que es lo que hacen?
Fluoruracilo: interfieren con la sntesis del timina,
inhibe al a enzima tinhidrato sintaza, donde un uracilo
se transforma en T.
Metotroxato: inhiben a esta enzima (imagen), que
tambin no permite que sintetice T, que ocurre cuando
una clula no sintetiza T? no puede sintetizar DNA, eso
es lo que queremos hacer, que la clula cancerosa no se
multiplique, Por qu busca atacar la sntesis de T?
porque es la base que se usa en la sntesis de solo DNA,
las otras no se pueden atacar, porque tambin se ocupan
en la sntesis de RNA, para la transcripcin, si
inhibiramos cualquier de las otras tres bases inhibiramos la
transcripcin de nuestros genes. Pero eso no quiere decir que
las drogas no sean toxicas para nuestro cuerpo, porque ataca a
las clulas que constantemente se estn reproduciendo, por
ejemplo, las clulas sanguneas, por eso las personas se quedan
sin sistemas inmune ( no hay linfocitos); y tambin que las
mucosas se llenan de heridas, (epitelio no se regenera, y al
detener la multiplicacin se pierde el moco). Por eso la
quimioterapia no se hace ms de 6 das.
La radioterapia es distinta, lo que busca es destruir el DNA a la
clula cancergena, los rayos se dirigen a la clula matando su
DNA.

TRANSCRIPCION DEL DNA

En esta diapo se muestra el dogma central de la biologa molecular, la

estructura del DNA, el modelo semiconservativo.
En el DNA estn los genes, y con la TRANSCRPCION algunos
segmentos cortos del DNA, (genes) vuelcan la informacin a una
molcula de RNA , despus este RNA es TRADUCIDO donde los
ribosomas, son capaces de leer esta informacin, (que esta en el RNA),
este idioma esta en 4 letras; entonces el ribosoma lo traduce en
aminocidos, (el diccionario que ocupa el ribosoma es el cdigo
gentico). Viendo las 3 posiciones de los codones se puede saber que
aminocido tiene que ir (traduccin, de acido nucleico a protena).
En los aos 70 se descubrieron unos virus que su genoma, no esta
guardado como DNA sino como RNA, y este RNA poda replicarse, lo
que no puede hacer nuestro organismo, en los 80 se descubrieron los
retrovirus que el RNA lo transforma DNA, lo hace en forma reversa,
con esto se duda del dogma central.
Pregunta: en el caso de los retrovirus que tienen rna y forma DNA, es
para siempre o para dividirse (creo que pregunta eso)
Lo vamos a ver en otra clase, por que lo retro virus
transforman su RNA en DNA. Pero para que no te
quedes en el aire, el RNA que se transforma a DNA
se introduce a la clula, pudiendo quedar por
muchos aos latente el virus (explicacin del SIDA
en donde pueden estar contagiados y no presentan
la enfermedad)
Esta ultima parte del dogma, hace algunos aos
estuvo apunto de derribarse, por que se
descubrieron unas partculas que se llaman priones
(producen neuro-degeneracin), que se comportan
como virus, uno se contagia con estos, se enferma y
despus puede contagiar. Se pens que eran virus
que mataba a las neuronas, pero cuando se
estudiaron y no encontraron el acido nucleico, eran puras protenas. Entonces un seor que se llama Stanley
Krusinger propuso que los priones son solo protenas y pueden multiplicarse sin la ayuda de cidos nucleicos.
Los priones son solo protenas y se multiplican, no por el concepto de multiplicacin que tienen los virus, no es
que un prion se divida y genere 2 priones. Lo que hacen los priones es alterar protenas que estn en nuestras
clulas, nosotros tenemos el gen que codifica para prion, pero la versin normal, el prion tiene otra estructura y
la altera y as se va a multiplicando.
Lo que hace, para decirlo con mas certeza, es que el prion no es q se multiplique, interacciona con otra protena
que es similar a el, y a esta el prion la cambia de forma externa, las protenas normales las transforma en
priones, y una vez transformadas, transforman a otras.
Ya lo hemos estado definiendo, y es que el gen es la porcin de DNA que se transcribe, un segmento del DNA
que se va a transcribir, o sea q se va a transformar en RNA.
Los genes se diferencian un poco entre procariontes y eucariontes. Los genes de los eucariontes estn
interrumpidos por unas secciones que se llaman intrones. La trascripcin pasa DNA a RNA, exones e intrones
juntos, y este RNA formado se transforma a RNA mensajero, una vez que se le han eliminado los intrones. Es
este RNAm el que sale del ncleo y es traducido en el citosol.
Los genes tienen 3 partes y una de esas partes es la que se transcribe, las otras dos tambin son parte del gen,
pero no se transcriben. Adems de eso hay muchas secuencias que no son genes y no que no se transcriben. Su
funcin es la gran pregunta y es lo que se esta investigando. Para que tanta informacin que esta ah y
aparentemente no sirve para nada. (En seminario se tratara este tema)

Los procariontes no tiene intrones,

el RNA trascrito es
inmediatamente el RNA
mensajero.
Siguiendo con las diferencia entre
procarionte y eucarionte,
partiendo por los eucariontes,
cada RNAm da origen a solo una
protena, por eso se conocen como
monocistronico. Entonces un
RNAm eucarionte tiene un
extremo 5 y otro 3, tiene
secuencias no codificantes
(AUG). Como funciona el
ribosoma? Se une en el extremo cercano al 5, reconoce el sitio de unin que se llama lugar de unin de los
ribosomas, se una ac y empieza a moverse por el RNAm hasta que encuentre el primer AUG, y desde ah
empieza a unir los amino cidos por triplete, sintetizando alguna protena, hasta que se encuentre con alguno de
los 3 codones de termino, y despus de este hay secuencias que son no codificantes.
En las bacterias es muy comn que tenga RNAm policistronicos, lo cual significa que en una solo RNAm
pueden estar codificadas varias protenas, esto ocurre solo en las bacterias, no en los eucariontes.
Las bacterias son capaces de producir varias protenas distintas a partir de un solo RNAm poniendo en su
secuencia un sitio de unin de los ribosomas, luego un codon de inicio (AUG), la secuencia que codifica a una
protena, un codon de termino y luego otro sitio de unin de un ribosoma, otro codon de inicio, etc.
Si uno pudiera ver una foto instantnea de un RNAm en las bacterias tendramos ribosomas unidos en distintas
partes, formando distintas protenas desde el mismo RNAm al mismo tiempo. Estas protenas q estn un RNA
policistronico, si bien son protenas distintas, no son protenas que no tengan q ver una con la otra. En el mismo
RNA policistronico se forman protenas que estn en la misma ruta metablica.
Es una ventaja o una desventaja? La ventaja es que pueden regular la produccin de varias protenas en poco
tiempo, pero la desventaja es que da menor flexibilidad, no pueden regular la produccin de las protenas por
separado, aunque esto tampoco les interesa. Estos pedazos, que se llaman operones (genes que codifican para
distintas protenas, que se transcriben todos juntos, en una sola molcula de RNAm), los han escuchado?,
por ejemplo las bacterias tienen rutas metablicas para sintetizar aminocidos, parten del compuesto 1 lo
transforman en 2, luego en 3 y finalmente sintetiza el aminocido que quiere. Todas estas acciones reguladas por
enzimas, en este ejemplo por la alfa, beta y gama. Y la bacteria utiliza estas 3 enzimas para sintetizar un
aminocido X. entonces a la bacteria le interesa tener las 3 enzimas al mismo tiempo que tenerlas por separado.
As la produccin de ese aminocido, que utiliza 3 enzimas distintas, esta regulado por un solo gen.
Los eucariontes como tenemos un genoma mayor
nos damos el lujo de poner el gen alfa beta y gama
por separado, aunque activemos los 3 juntos, pero
nos da la posibilidad de activar uno mas que otro en
caso de ser necesario. Eso si es mas complejo tenerlo
por separado que los tres juntos.
(Preguntas sobre los antibiticos, los cuales
bloquean a los ribosomas y no se producen
protenas, no es que cambien el cdigo o los bloquen
los operones. Y la resistencia es por una mutacin la
cual produce que los ribosomas que eran sensibles al
antibitico, ahora son resistentes)
Estos son los operones de las bacterias, que mas
adelante hablaremos ms de ellos. Entonces los
eucariontes no tenemos operones, nuestros genes son todos independientes, mayor complejidad y mayor
regulacin.

Es muy comn encontrar en los libros las definiciones de gen, muchas veces leern, secuencia de DNA que
codifica una protena, eso es parcialmente falso. Porque hay genes que no codifican protenas, algunos genes si
codifican para protenas y estos son los que dan origen a RNAm. O sea del DNA pasa al RNAm y este codifica
una protena. Pero adems hay genes que no estn destinados a codificar protenas sino que por ejemplo el RNA
de transferencia (que llevan el aminocido para producir la protena), la funcin de este RNA trascrito no es
producir protena, sino que funcionar como RNA, y estn codificado en genes, genes que producen RNA. Estn
tambin los RNA ribosomales, q tambin solo funcionara como RNA y no codificara para una protena. Todos
estos codificados en genes, genes que no codifican para protena.
Adems hay un tercer tipo de RNA que no es muy conocido, que son los RNA nucleares pequeos, snRNA, son
RNA que estn en el ncleo y son pequeos (ja), y participan en el procesamiento de intrones, lo que conocemos
como splicing.
Los nicos RNA que codifican para protena son los RNAm, entonces una definicin mas correcta seria
secuencia de DNA que se transcribe y da origen a un RNA, lo que pase con el RNA es otra historia.
Las diferencias entre el DNA y el RNA son que el primero es doble hebra. Adems esta las azucares de las
bases, en el C2 donde esta el grupo H o OH y tercera diferencia son la timina y el uracilo (entre ambos solo se
diferencian en un grupo metilo).

Ahora vamos a hablar de la estructura de los genes, los genes tienen 3 partes, un codificador, un promotor y un
regulador. El codificador es la zona que se transcribe, la que forma el RNA es el codificador, aqu estn los
intrones y los exones, al comienzo de esta parte esta el sitio de unin de los ribosomas, etc. La segunda parte es
el promotor, el cual es una secuencia de DNA que no se transcribe, no produce RNA, pero ac es donde se une
el RNApolimeraza (la enzima que transcribe el DNA), esta reconoce al promotor y se une a el. El
RNApolimeraza se une en la secuencia TATA, llama caja TATA, y esta secuencia se encuentra e todo el
promotor y si la secuencia TATA no esta el promotor no funciona. Y otra secuencia que esta en el promotor es
la secuencia CAAT, todo esto esta en el promotor.
En el DNA hay unos nmeros ( 1, -1 , -25), los cuales marcan la posicin de DNA, es una nomenclatura. La
posicin +1, es donde comienza la trascripcin.
Hay genes que son muy largos, pueden llegar hasta 5000 bases que se transcriben. Y todo lo que este a la
izquierda de +1 es negativo, y la caja TATA esta en la posicin -25.
Esto siempre es as?
Esto es como un consenso, pero el promotor no da mucha flexibilidad. El promotor tiene que estar muy cerca de
donde se va a iniciar la transcripcin, porque aqu se va a unir la rna polimerasa y la rna polimerasa va a
comenzar a transcribir hacia ac, entonces yo no puedo poner el promotor muy lejos, la transcripcin comienza
inmediatamente donde est el promotor. En cambio el tercer elemento que es el regulador, puede estar a
distancias muy variables, por eso ah est interrumpida la lnea: exones como rectngulo e intrones como lnea
continua. Entonces ah est interrumpido y esto quiere decir que ac podemos tener distancias muy variables e
incluso podemos variar con ingeniera gentica, podemos tomar un regulador y lo muevo y lo dejo ms cerca e
= funciona.

El regulador es muy importante, porque es ac donde se unen los factores de transcripcin especficos, podemos
resumir esto diciendo que el promotor le indica a la clula, donde hay un gen o dicho de otra manera donde hay
que empezar a transcribir, recuerden que este gen est incluido en el genoma, que la clula tiene que identificar.
Entonces lo primero que hace la clula es identificar donde hay un promotor, aqu hay un gen entonces aqu
vamos a unir la rna polimerasa que va a transcribir lo que est hacia el otro lado. Entonces el promotor le seala
a la clula donde estn los genes y el regulador lo que hace es indicarle a la clula cuando un gen se tiene que
activar y dondeen qu tipo de clulas. (Explicacin de los 25 mil genes y que no todos se expresan). Como se
hace esto, con unas protenas llamadas factores de transcripcin especficos que se unen ac y le dicen a este
gen se active. Y tambin en una misma clula un gen que est activo no est siempre activo, esto es muy
dinmico el gen se activa, se silencia, etc., segn los requerimientos de protenas que tenga esa clula. Todo lo
anterior sucede gracias a reguladores y factores de transcripcin especficos.
La transcripcin es un proceso muy parecido a la replicacin
del DNA. La transcripcin cumple las mismas reglas que la
replicacin. Se sintetiza el rna la direccin 53 y la hebra
que se lee del DNA es de 35. Ahora hay una diferencia
entre estas dos, en la replicacin las dos hebras de DNA se
van separndose y en la transcripcin el DNA tambin se va
separando, pero como una especie de burbuja muy pequea,
por donde va avanzando la rna polimerasa, va leyendo el
DNA, donde momentneamente se han separado la dos
hebras y la polimerasa pasa por ah y seguir avanzando y el
DNA que est atrs volver a formarse doble hebra (abre y
se cierra).
Los genes estn codificado en UNA SLA HEBRA! Pero
eso slo ocurre en eucariotas, en virus no sucede lo mismo.
El rna que se produce es = a la otra hebra (por
complementariedad y explicacin de la presencia de uracilo en rna (U en vez de T)********que es un misterio
de la naturaleza).
La polimerasa reconoce el promotor se une y en el promotor se
empiezan a separar las cadenas de DNA, la polimerasa empieza a
avanzar y va leyendo de 3 a 5 y va produciendo el rna, va
avanzando y fjense que lo que va quedando atrs (******).
Avanza el rna cada vez mas largo y hasta que la polimerasa se
encuentra con una seal que le indica que tiene que parar de
transcribir. Aqu termina el gen, la polimerasa se despega y se
tiene rna sintetizado.
Secuencia: seal de trmino de transcripcin, pero la polimerasa no termina justo ah, cuando se encuentra con
esta secuencia avanza un poco ms y ah termina.
AUG inicio de la traduccin! No transcripcin
Tenemos distintos tipos de rna polimerasa, cada uno tiene una funcin distinta por ejemplo, la polimerasa 1
sintetiza los rna ribosomales, p2 sintetiza rna (******), p3 sintetiza rna transferencia. Todas hacen transcripcin
qu genes transcriben? Son distintos
Por qu la secuencia TATA del promotor es tan importante?: si una letra cambia, el promotor deja de funcionar y
el gen se inactiva. Y eso es por lo siguiente: aqu est el dna, aqu la secuencia del promotor y quiero explicarles
como empieza la transcripcin: lo primero que ocurre es que hay una protena que es TBP (tata binding protein)
y esa es la primera protena que llega al promotor reconoce la secuencia TATA y se une a ella. La unin de la
protena a la caja TATA produce un cambio en la estructura del dna (de alguna manera se dobla) y despus que
ocurre eso empiezan a llegar un montn de otras protenas que se van uniendo formando una cascada
secuencial, todas se llaman TF (transcription factor no hay que aprendrselas ni tampoco su orden de llegada).
Esta protena grandota que uds ven ac, es la rna polimerasa que llega tambin asociada a un factor de
transcripcin, se une y despus siguen llegando ms FT, formndose un complejo de muchas protenas y
llamamos a esto el complejo de iniciacin de la transcripcin (tiene que armarse este complejo para que la
transcripcin pueda empezar). Una vez que la transcripcin empieza, los ft se despegan de la polimerasa y la

dejan sola sintetizando rna y los FT estn libres para

volver a repetir el ciclo. Todo esto ocurre en el ncleo.
Ahora la TBP va a poder unirse al promotor slo si el
promotor no est unido a histona, porque las histonas
bloquean la transcripcin. Ahora esto se llama
maquinaria de transcripcin basal pk si bien esto es
necesario para que ocurra transcripcin no es suficiente.
qu falta? Es la seal del reguladores el regulador
quien le da la orden a la polimerasa para partir. El
regulador fosforila rna polimerasa (se activa) y parte
transcripcin.
Estabilidad y Desestabilidad de molculas de la herencia
DNA es muy estable, pero el rna es muy inestable. La explicacin biolgica: ah est guardad info. Gentica y si
la clula se destruye son como el disco duro del PC. En cambio el rna no guarda info. gentica, pero
puede ser estable como el rna pk no lo es? El rna a vercundo se produce el rna?...cundo una clula
activa un gen?, cuando lo necesita para fabricar la protena. Imagnese que el rna fuera muy estable, que
permaneciera mucho tiempo en la clulala clula apagara el gen, pero no frenara de inmediato la produccin
de protenas, porque el rna est ah. A la clula le conviene que sea estable para que a penas no lo necesite ste
ya no exista. El rna es inestable pk dentro de la clula hay unas enzimas que lo destruyen que se llaman rnasas y
estn en todas las partes de la clula.
Resulta que estas rnasas son enzimas que actan muy rpido. Apenas ven el rna lo atacan y lo destruyen
rpidamente. Osea, la clula quiere que el rna sea estable, para producir algo de protenas, entonces qu hace la
clula, pues lo protege. La rnasa se une al extremo del rna y empiezan a atacar rompiendo los enlaces
fosfodister y sacan los nucletidos y este ocurre muy rpido. Entonces qu hace la clula? Lo protege en sus
extremos, para que a la rnasa le cueste destruirlos y
cuando la rnasa rompe la proteccin rpidamente
comienza a degradar el rna. Entonces estas
protecciones son las siguientes: en el extremo 5 el
rna mensajero tiene un elemento que se llama CAP.
qu es el cap? Es un nucletido modificado que se
llama 7metilguanosina pk es una guanosina con un
metilo. (la guanosina comn y corriente no tiene el
metilo). Otra cosa distinta a un nucletido comn y
corriente es que esta molcula tiene un enlace con
tres fosfatos y el enlace fosfodister el 55. Esto
hace que la rnasa le cuesta sacar el CAP, porque la
rnasas destruye el fosfodister 53 muy rpido. As
el RNA dura lo justo y necesario.