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TEMA 11.

VIRUS BACTERIANOS CON ARN


Introduccin
Una gran diferencia es el material gentico que es ARN, diferente al del
hospedador. El hecho de que presenten este material genetico va a
complicar la situacin porque va a tener que sintetizar protenas, generar
copias del material y regular la gestin de este.
Virus con ARN monocatenario: Levivirus
Son virus desnudos, carentes de envoltura y no presentan ni espculas ni
fibras ni cola. Son muy pequeos (24-26 nm y 80S).
Dentro de los Levivirus se incluyen numerosos virus distintos pero
destacamos MS2 y Qb por su hospedador que es E. coli.
Estructuralmente tienen una cpsida icosaedrica con el nmero de
triangulacin es 3. esta cpsida esta formada por dos protenas diferentes
pero una de ellas es muy mayoritaria (189 copias) y otra protena de la cual
encontramos una sola copia por cpsida, lo que nos indica que tendr
alguna funcin.
Con respecto al material gentico. El ARN es monocatenario positivo
bastante pequeo pero ms all de las diferencias de tamao tienen
elementos estructurales comunes. En el extremo 5' predominan las guatinas
y en el 3' las citosinas. Ciertamente los levivirus presentan ARN
monocatenario pero en el momento en el que se enfrentan dos regiones con
bases complementarias peuden formas estructuras secundarias como
bucles. De hecho en el caso de los levivirus se ha establecido que en torno
al 74% de la secuencia estn formando esta estrctura terciaria. Este
plegamiento tiene consecuencia en cmo se gestiona el material gentico.
Con respecto a la informacin que contiene:
MS2 codifica solo para 4 protenas: la protena de la cpsida y el enzima que
se va a encargar de replicar el material gentico. Es muy importante por el
ARN que a partir de este se tienenq eu sintetizar ADN y esta actividad no es
propia del hospedador, es especfica del fago. Tambin hay un gen que
codifica para una protena implicada en la lisis. Este gen presenta
solapamiento entre el gen de la cpsida y la replicasa.
A la protena A la relaciona con el proceso de maduracin pero no es as.
Esta implicada sobre todo en la adsorcin .
Respecto al QB el mapa gentico es similar. Tenemos una protena A1 y A2 y
dos protenas que no son estructurales.
En este caso no hay solapamiento de genes si no otra estrategia que es el
fallo en la seal de stop para poder sintetizar dos protenas diferentes a
partir del mismo cdigo.
Ciclo de multiplicacin:
Adsorcin y entrada:
Por parte de la bacteria, el receptor bacteriano son los pelos sexuales, y el
receptor viral la protena A ya que es una protena piloto. Conduce el
material genetico al interior de la celula. Una vez dentro la protena es
escindida por endonucleasas en dos factores.

De los sitios de unin a ribosomas, el unico disponible va a ser la protena


de la cpsida. Es una protena estructural y habitualmente estas protenas
suelen sintetizarse de forma tarda. En este caso lo primero que se sintetiza
es la protena estructural. El ribososma avanza y en determinado momento
se encuentra con ARN de cadena doble y lo va abriendo. Se va quedadno al
descubierto el sitio de unin al ribosoma.
Sntesis de la protena A1 del fago QB: parte de la protena de la cpsida
estn en la A1. En la mayora de los casos el ribosoma va a identificar el
codn de terminacin y se va a terminar ah la sntesis de protenas. Lo que
sucede es que en un reducido porcentaje de casos este codn de
terminacin no es interpretado adecuadamente, se introduce un triptfano y
contina la lectura, avanzando a una nueva localizacin donde se detiene.
Se forma una nueva protena de mayor tamao que es la protena A1.
Replicacin viral: es esencial que se sintetice la replicasa viral. La sintesis de
esta protena es consecuencia de la sntesis de la protena de la cpsida. Se
forma un complejo replicasa con un pptido viral. Para ello va a tener
afinidad por tres protenas celulares. La replicasa, ese complejo que se
encarga de la replicacin, est constituido por 4 potenas, 1 de ellas que
procede del virus y las otras 3 del hospedador. La actividad de este coplejo
es ARN polimerasa, sntesis de ARN a partir de ARN. El Arn que se obtiene
tendr polaridad negativa. Esta copia es un intermediario replicativo. No
constituye el genoma final. A partir de esta copia y de nuevo en sentido 5'
3', se generarn las copias en +.
Sntesis de protenas tardas: hay que sintetizar al menos una copia de la
protena A por cada partcula viral que se vaya a sintetizar. El nico sitio
accesible inicialmente es la protena de la cpsida. En el caso del MS2 la
sintesis de esta protena tiene lugar cuando est sucediendo el paso de la
cadena a +. a medida que se va sintetizando, se van formando bucles y
ocultando sitios de unin a ribosoma por lo que cuando empieza a
sintetizarse el 5', antes de que empiece a plegarse.... PERDIDA AQU.
Regulacin de los niveles de protenas: es muy importante esta regulacin
debido a la situacin en la que nos encontramos. La regulacin en el tiempo
pero tambien hay que regular las cantidades de protena ya que no se
necesitan de igual manera las protenas de la capsida que la protena A.
esto se gestiona de la siguiente manera:
Papel de la proteina de la capsida: a medida que se acumula en el interior
celular va a bloqueara la sintesis de la replicasa lo que no se va a replicar el
material genetico. Este proteina tiene actividad enzimatica por lo que ssolo
se necesitan unas pocas copias para que lleve a cabo su funcin. La
estructura secundaria despues del paso del ribosoma es distinta a la de
antes de su paso. Esa distinta conformacion hace que ahora tenga
apetencia la proteina de la capsida para unirse por lo que el ribosoma ya no
va a leer y no se va a sintetizar mas replicasa.
Papel de la protena A: se genera una copia cada vez que se genera una
copia de ARN con polaridad positiva. Por cada partcula viral se necesita una
sola protena A por lo que no habr ningn problema.

Papel de la replicasa: un inconveniente de estos virus es que el mismo


material gentico debe ser utilizado para ser copiado, para ser traducido y
sintetizar protenas y para ser empaqueato pero la transcripcin y
traduccin ocurren en sentidos diferentes. Por lo que la traduccin sera
llevada por ribosomas y transcripcin por replicasas. La replicasa cuando
tiene qe efectuar su funcin no queremos que ese genoma est siend
utilizado por el ribosoma por lo que se va a unir a una regin central del
ARN viral y va a impedir que se sintetice esta protena de la cpsida por lo
que va a impedir que se use para la traduccin ya que ella lo usar para la
transcripcin.
Destino del ARN sintetizado:
En las fases iniciales el ARN se usa como molde para la replicacin. Si hay
pocas protenas de la cpsida se utilizar para ser traducido, se sintetiza
protena de la cpsida que a medida que se vaya acumulando ya no se
sintetiza replicasa. Cuando hay muchas copias de a protena de la cpsida....
Maduracin y liberacin
Entra en juego la protena de la lisis.
Inters: permiti en su momento tener una panormica ms o menos
completa de la estructura gentica y la informacin de los genes. El
mecanismo de replicacin es especial y desde nuestro punto de vista el
estudio de los levivirus result interesante porque hay virus de animales que
presentan este mismo tipo de material gentico y su gestin es similar.

Virus con ARN bicatenario: Cystovirus

Fagos que presentan ARN bicatenario, situacin que nunca se encuentra en


el hospedador, y adems fragmentado, tiene 3 molculas.
Otra diferencia es que son virus envueltos, con una envoltura lipdica que
procede de la membrana citoplasmtica del hospedador con alguna
modificacin. Un ejempl es el fago fi6, cuyo hospedador es Pseudomonas. Es
un virus mas complejo con una mayor informacin gentica.
La actividad enzimtica asociada a la gestin del material gentico es una
actividad transcriptasa, pasa de ARN bicatenario a ARN monocatenario.
Material gentico:
Tres molculas de diferentes tamaos.
Es un virus envuelto por lo que el ciclo va a ser diferente. La proteina 3
interacciona con los pelos sexuales, se retrae el pelo, se acerca la particula
viral, la proteina p6 favorece la fusoin entre la envoltura del virus y la
membrana plasmatica, ahi actua la p5 que genera poros y permite que pase
al interior de la bacteria y no solo el material genetico sino la nucleocpsida.
El material genetico en ningun caso va a quedar desnudo dentro del
hospedador, porque este trataria de degradarlo.
Sintesis de proteinas
Cmo? Si el material genetico no esta en el citoplasma? Es una sntesis
semiconservativa. Implica que una de las cadenas de ARN va a ser copiada,
concretamente la que tiene polaridad -, de tal manera que la cadena que se
sintetiza tiene polaridad +. esa cadena sintetizada permanecer unida a la
cadena parenteral mientras que la positiva parenteral ser la que abandone

la nucleocpsida y como tiene polaridad + podr ser traducida y a partir de


ahi se generar un polipeptido. Essto ocurre para los 3 fragmentos de ARN.
Diferencia con la conservativo: el ARN bicatenario es el molde y lo que se
sintetiza nuevo es lo que se exporta.
Maduracin y ensamblaje: las proteinas interaccionan entre sy mediante
estas interacciones se van incorporando las copias que los fragmentos de
ARN. Si nos fijamos lo que se incorpora son ARNm, es decir,
monocatenarios, por lo que tendremos que pasar a ARN bicatenaio. La
actividad transcriptasa del virus genera la copia. Esta capsida migrara a la
membrana citoplasmatica donde habra proteinas virales inmersas en la
bicapa lipidica y abandonar mediante un proceso similar al de gemacin.

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