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RESUMEN

AMINOCIDOS
Esenciales y no esenciales
Los esqueletos carbonados de numerosos aminocidos pueden derivarse de metabolitos en las
vas centrales, permitiendo la biosntesis de algunos aminocidos, pero no de todos, en los seres
humanos. Por tanto, los aminocidos que pueden sintetizarse de esta manera no son necesarios
en la dieta (aminocidos no esenciales), mientras que los aminocidos que tienen esqueletos
carbonados que no pueden derivarse del metabolismo humano normal deben aportarse con la
dieta (aminocidos esenciales).
Clasificacin de los aminocidos segn la estructura qumica de sus cadenas laterales
Las propiedades de cada aminocido dependen de su cadena lateral (-R); las cadenas laterales
son los grupos funcionales que determinan la estructura y la funcin de las protenas, as como la
carga elctrica de la molcula.

Aminocidos alifticos (alanina, valina, leucina e isoleucina): Tienen hidrocarbonos


saturados como cadenas laterales. La glicina, que solamente tiene un hidrgeno como
cadena lateral, se incluye tambin en este grupo. Todos estos aminocidos son
hidrofbicos.
Aminocidos aromticos (La fenilalanina, la tirosina y el triptfano tienen cadenas laterales
aromticas) Los aminocidos apolares alifticos y aromticos suelen encontrarse
enterrados en el interior de la protena y estn involucrados en interacciones hidrofbicas
entre ellos.
Aminocidos polares neutros (La serina y la treonina): los aminocidos polares neutros
contienen grupos hidroxilo o amida en su cadena lateral. Estos aminocidos se encuentran
a veces en los centros activos de protenas catalticas, las enzimas.
Aminocidos cidos: Los cidos asprtico y glutmico contienen cidos carboxlicos en sus
cadenas laterales y estn ionizados a un pH de 7,0 y, como resultado, transportan cargas
negativas en sus grupos carboxi- lo.
Aminocidos bsicos: Las cadenas laterales de la lisina y la arginina estn completamente
protonadas a pH neutro y, por tanto, estn cargadas positivamente.
Aminocidos que contienen azufre: La cistena y su forma oxidada, la cistina, son
aminocidos que contienen azufre y que se caracterizan por su baja polaridad. La cistena
desempea un papel importante en la estabilizacin de la estructura de las protenas, dado
que puede participar en la formacin de puentes disulfuro con otros residuos de cistena
para formar residuos de cistina, con lo que las cadenas de protenas quedan entrelazadas
y as se estabiliza la estructura de la protena.

Carga neta
Las formas cargada y no cargada de los grupos cidos dbiles COOH y NH3+ ionizables que
existen en solucin en equilibrio protnico:

Si bien tanto el RCOOH como el RNH3+ son cidos dbiles, RCOOH es un cido mucho
ms fuerte que RNH3+. A pH fisiolgico (pH de 7.4), los grupos carboxilo existen casi por
completo como RCOO y los grupos amino de manera predominantecomo RNH3+. Las
molculas que contienen un igual nmero de grupos ionizables de carga opuesta y que, por ende,
no portan carga neta, reciben el nombre de zwitteriones.
El pH isoelctrico, tambin llamado pI, es el pH a la mitad entre valores de pKa para las
ionizaciones a ambos lados de las especies isoelctricas. Para un aminocido como la alanina
que slo tiene dos grupos que se disocian, no hay ambigedad. La primera pKa (RCOOH) es
2.35, y la segunda (RNH3+) es 9.69; de este modo, el pH isoelctrico (pI) de la alanina es

PROTENAS
La sntesis de protenas o traduccin representa la culminacin de la transferencia de la
informacin gentica, almacenada en forma de bases de nucletidos en el cido
desoxirribonucleico (ADN), a las protenas, que son los principales componentes estructurales y
funcionales de las clulas. Durante la traduccin, la informacin expresada en forma de una
secuencia de nucletidos especfica en una molcula de cido ribonucleico (ARNm) se utiliza
para dirigir la sntesis de una protena. A continuacin, la protena se pliega y adopta una
estructura tridimensional, definida en gran parte por su secuencia de aminocidos.
ESTRUCTURAS DE UNA PROTENA
Estructura primaria de las protenas
La estructura primaria de las protenas es la secuencia lineal de sus aminocidos. En las
protenas, el grupo carboxilo de un aminocido se une al grupo amino del aminocido siguiente,
formando un enlace amida (pptido): durante la reaccin se elimina agua.

Las unidades de aminocidos de una cadena peptdica se denominan residuos aminocidos. Una
cadena peptdica formada por tres residuos aminocidos se denomina tripptido; un ejemplo es el
glutatin. Por convencin, el amino terminal (N-terminal) se considera el primer residuo y la
secuencia de aminocidos se escribe de izquierda a derecha. Cuando se escribe la secuencia
peptdica se utilizan las abreviaciones de los aminocidos con tres letras o con una, como Asp-
Arg-Val-Tyr-Ile-His-Pro-Phe-His-Leu. Este pptido es la angiotensina, una hormona peptdica que
influye sobre la presin arterial
Estructura secundaria de las protenas
La estructura secundaria de las protenas est determinada por las interacciones mediante
puentes de hidrgeno entre los grupos funcionales de las cadenas laterales de los aminocidos.
La estructura secundaria de una protena hace referencia a la estructura local de la cadena
polipeptdica. Esta estructura est determinada por las interacciones mediante puentes de
hidrgeno entre el oxgeno del grupo carbonilo de una cadena peptdica y el hidrgeno de amida
de otro puente peptdico cercano. Existen dos tipos de estructura secundaria: la hlice alfa y la
hoja plegada beta.

Hlice alfa: la hlice a es una estructura en forma de varilla con la cadena peptdica
fuertemente enrollada y con las cadenas laterales de los residuos aminocidos
extendindose hacia fuera del eje de la espiral. Cada grupo carbonilo amdico est unido
mediante un puente de hidrgeno al hidrgeno del grupo amida de un enlace peptdico que
est a una distancia de cuatro residuos a lo largo de la misma cadena.
Hoja plegada beta: Si los enlaces de hidrgeno se forman lateralmente entre enlaces
peptdicos, las secuencias polipeptdicas se ordenan de forma paralela o antiparalela entre
s en una disposicin que se denomina hoja plegada beta. La hoja plegada beta es una
estructura extendida, a diferencia de la hlice a, que est enrollada. Est plegada porque
los enlaces carbono-carbono (C-C) son tetradricos y no pueden existir en una
configuracin plana.
Estructura terciaria de las protenas
La estructura terciaria de una protena est determinada por las interacciones entre los grupos
funcionales de la cadena lateral, incluyendo adems a los puentes disulfuro, los puentes de
hidrgeno, los puentes salinos y las interacciones hidrofbicas.
Se denomina estructura terciaria de una protena a su conformacin tridimensional, plegada y
biolgicamente activa. Esta estructura refleja la forma global de la molcula y por lo general
consta de varias unidades pequeas de menor tamao tambin plegadas denominadas dominios.
La estructura terciaria de las protenas se determina mediante cristalografa de rayos X y
espectroscopia de resonancia magntica.
La estructura cuaternaria
Est formada por interacciones entre cadenas peptdicas. La estructura cuaternaria de protenas
con mltiples subunidades est determinada por interacciones covalentes y no covalentes entre
las superficies de las subunidades La estructura cuaternaria hace referencia a un complejo o un
ensamblaje de dos o ms cadenas peptdicas que se mantienen unidas por interacciones no
covalentes o, en algunos casos, covalentes.
PROTENAS COMO AMORTIGUADORES
Los aminocidos y las protenas son amortiguadores excelentes en condiciones fisiolgicas. Los
amortiguadores son soluciones que minimizan un cambio en la [H+], es decir, en el pH, al aadir
un cido o una base. Una disolucin amortiguadora que contenga un cido dbil o una base dbil
y un ion de carga contraria tiene una capacidad de amortiguacin mxima a su pKa, es decir,
cuando las formas cidas y bsicas estn presentes a la misma concentracin. La forma cida
protonada reacciona con la base aadida y la forma bsica no protonada neutraliza el cido
aadido, como se muestra a continuacin para un compuesto amino:

Una disolucin de alanina tiene una capacidad de amortiguacin mxima a pH 2,4 y 9,8, es decir,
al pKa de los grupos carboxilo y amino, respectivamente.
Desnaturalizacin de las protenas
En el estmago, el HCl segregado reduce el pH a 1-2, con la consiguiente desnaturalizacin de
las protenas de la dieta. La desnaturalizacin despliega las cadenas polipeptdicas y hace que
las protenas sean ms accesibles a las proteasas. Adems, las clulas parietales de la mucosa
gstrica secretan pepsina, que se libera en forma de su precursor inactivo, pepsingeno, y se
activa mediante una reaccin intramolecular (autoactivacin) a un pH por debajo de 5 o por la
pepsina activa (autocatlisis). A un pH por encima de2, el pptido liberado permanece unido a la
pepsina y acta como inhibidor de la actividad de la misma. Esta inhibicin se elimina bien por el
descenso del pH por debajo de 2 o por la accin ulterior de la pepsina. Los principales productos
de la digestin de las protenas por la pepsina son fragmentos peptdicos grandes y algunos
aminocidos libres.
CARACTERSTICAS DE LA PROTENA GLOBINA
La mioglobina humana est formada por un solo polipptido de globina (153 residuos
aminocidos). La hemoglobina humana es un ensamblaje tetramrico de 2 polipptidos de alfa-
globina (141 residuos) y 2 polipptidos de beta-globina (146 residuos). Un grupo prosttico hemo
se asocia de modo no covalente con cada apoprotena globina.
La estructura secundaria de las globinas de mamferos presenta una elevada proporcin de
hlices alfa, con ms del 75% de los aminocidos asociados con 8 segmentos helicoidales. Estas
hlices a estn estrechamente empaquetadas y dispuestas en una estructura terciaria casi
esfrica, denominada plegamiento de globina.
Los aminocidos polares se hallan casi exclusivamente en la superficie exterior de los
polipptidos de globina y contribuyen al elevado grado de solubilidad de estas protenas. Los
aminocidos que tienen caractersticas polares e hidrofbicas, como treonina, tirosina y triptfano,
tienen orientadas sus funciones polares hacia el exterior de la protena. Los residuos hidrofbicos
estn enterrados en el interior, donde estabilizan el plegamiento del polipptido y forman un
bolsillo que acomoda el grupo prosttico hemo. Son notables excepciones a esta distribucin
general de los residuos aminocidos de las globinas las 2 histidinas que desempean un papel
clave en la funcin de la protena y que se disponen en la profundidad del bolsillo del grupo hemo.
Las cadenas laterales de estas histidinas estn orientadas perpendicularmente a cada lado del
grupo prosttico hemo. Uno de los nitrgenos imidazlicos de la cadena lateral del residuo
invariable de histidina proximal (HisF8) se encuentra lo bastante cerca para unirse directamente al
tomo pentacoordinado de Fe2+. En el lado opuesto del plano del grupo hemo se encuentra la
histidina distal (HisE7), que se halla demasiado lejos del hierro del grupo hemo para establecer un
enlace directo; su funcin es indispensable para estabilizar el 02 mediante puentes de hidrgeno.
ESTRUCTURA DEL GRUPO PROSTTICO HEMO
El grupo hemo, la parte fijadora de O2 comn a la Mb y la Hb, es una molcula de porfirina que
tiene coordinado un tomo de hierro (Fe2*)
El grupo prosttico Fe-porfirina es plano e hidrofbico, con la excepcin de 2 grupos propionato
expuestos al disolvente. El grupo hemo constituye un componente integral de las holoprotenas
de globina durante la sntesis de los polipptidos; es el grupo hemo el que confiere a las globinas
su color rojo prpura caracterstico, prpura en el estado desoxigenado en la sangre venosa y
rojo en el estado oxigenado en la sangre arterial.
Las globinas aumentan la solubilidad en agua del grupo prosttico hemo, que de otro modo sera
poco soluble e hidrofbico. Una vez secuestrado en el interior de un bolsillo hidrofbico creado
por el polipptido de globina plegado, el grupo hemo se encuentra en un ambiente protector que
minimiza la oxidacin espontnea de Fe2+ (ferroso) a Fe3+ (frrico: oxidacin) en presencia de
O2. Tambin es esencial un entorno semejante para que las globinas fijen y liberen O2. Si el
tomo de hierro se oxida a Fe3+, el grupo hemo ya no puede interaccionar de modo reversible
con el O2, lo que altera finalmente su funcin de almacenamiento y de transporte de O2.
MIOGLOBINA
La Mb fija el 02 que la Hb ha liberado en los capilares de los tejidos y que posteriormente difunde
a los tejidos
Localizada en el citosol del msculo esqueltico, cardaco y algunas clulas musculares lisas, la
mioglobina almacena una reserva de O2 de la que pueden disponer fcilmente los distintos
orgnulos, especialmente la mitocondria, que realiza el metabolismo oxidativo. Con un nico lugar
de fijacin al ligando, la reaccin reversible de la Mb y el O2:
HEMOGLOBINA
La Hb es la principal protena transportadora de O2 de la sangre humana; se encuentra
exclusivamente en los hemates.
La Hb adulta (HbA) tiene una disposicin tetradrica de 2 subunidades idnticas de alfa-globina y
2 subunidades idnticas de (beta-globina, una geometra que predice los diversos tipos de
interacciones que pueden existir entre ellas en la estructura cuaternaria. En la estructura
tetradrica de la Hb, cada subunidad est en contacto con las otras tres. El nmero real y la
naturaleza de los contactos difieren en presencia o ausencia de O2. Las asociaciones fuertes en
cada heterodmero alfa beta y en la interfase entre los dos heterodmeros constituyen factores
determinantes en la fijacin y la liberacin de O2.
OXIGENACIN DE LA HEMOGLOBINA
Las hemoglobinas unen cuatro molculas de O2 por cada tetrmero, uno por cada hem. Una
molcula de O2 se une a un tetrmero de hemoglobina con mayor facilidad si otras molculas de
O2 ya estn unidas. Este fenmeno, llamado unin cooperativa, permite a la hemoglobina
maximizar tanto la cantidad de O2 cargado a la Po2 de los pulmones, como la cantidad de O2
liberado a la Po2 de los tejidos perifricos. Las interacciones cooperativas, una propiedad
exclusiva de protenas multimricas, tienen importancia crucial para la vida aerbica.
La p50 expresa las afinidades relativas de diferentes hemoglobinas por el oxgeno. La cantidad
P50, una medida de la concentracin de O2, es la presin parcial de O2 que satura 50% de una
hemoglobina dada. Dependiendo del organismo, la P50 puede variar de manera significativa, pero
en todos los casos exceder la PO2 de los tejidos perifricos; por ejemplo, los valores de P50
para la HbA y la HbF son de 26 y 20 mm Hg, respectivamente.
Despus de liberar O2 en los tejidos, la hemoglobina transporta cO2 y protones hacia los
pulmones. Adems de transportar O2 desde los pulmones hacia los tejidos perifricos, la
hemoglobina transporta CO2, el subproducto de la respiracin, y protones, desde los tejidos
perifricos hacia los pulmones. La hemoglobina porta CO2 como carbamatos formados con los
nitrgenos amino terminal de las cadenas polipeptdicas.

Los carbamatos cambian la carga de terminales amino desde positiva hacia negativa, lo que
favorece la formacin de puentes salinos entre las cadenas y . Los carbamatos de
hemoglobina explican alrededor de 15% del CO2 en la sangre venosa. Gran parte del CO2
restante se transporta como bicarbonato, que se forma en los eritrocitos mediante la hidratacin
de CO2 hacia cido carbnico (H2CO3), un proceso catalizado por la anhidrasa carbnica. Al pH
de la sangre venosa, el H2CO3 se disocia hacia bicarbonato y un protn.

La desoxihemoglobina une un protn por cada dos molculas de O2 liberadas, lo que contribuye
de manera significativa a la capacidad amortiguadora de la sangre. El pH un poco ms bajo de los
tejidos perifricos, auxiliado por la reaccin de carbamacin, estabiliza el estado T y, as, aumenta
el aporte de O2. En los pulmones, el proceso se revierte. A medida que el O2 se une a la
desoxihemoglobina, se liberan protones y se combinan con bicarbonato para formar cido
carbnico. La deshidratacin del H2CO3, catalizada por la anhidrasa carbnica, forma CO2, que
se exhala. De este modo, la unin de oxgeno impulsa la exhalacin de CO2. Este acoplamiento
recproco de unin de protn y O2 se denomina efecto Bohr, el cual de pende de interacciones
cooperativas entre los hemes del te trmero de hemoglobina. La mioglobina, un monmero, no
muestra efecto Bohr.
MUTACIONES
Hemoglobina s
En la HbS, el aminocido no polar valina ha remplazado al residuo de superficie polar Glu6 de la
subunidad , lo que genera un parche pegajoso hidrofbico sobre la superficie de la subunidad
tanto de la oxiHbS como de la desoxi-HbS. Tanto la HbA como la HbS contienen un parche
pegajoso complementario sobre sus superficies, que slo queda expuesto en el estado T
desoxigenado. De este modo, a Po2 baja, la desoxiHbS puede polimerizarse para formar fibras
insolubles largas. La unin de la desoxiHbA termina la polimerizacin de fibra, puesto que la HbA
carece del segundo parche pegajoso necesario para unir otra molcula de Hb. Estas fibras
helicoidales torcidas producen una deformacin falciforme caracterstica del eritrocito, lo que le
hace vulnerable a lisis en los intersticios de los sinusoides esplnicos. Tambin causan mltiples
efectos clnicos secundarios. Una Po2 baja, como la que ocurre a grandes altitudes, exacerba la
tendencia a polimerizarse.
Metahemoglobina
En la metahemoglobinemia, el hierro hem es frrico en lugar de ferroso, as que la
metahemoglobina no puede unirse a O2 ni transportarlo. En circunstancias normales, la enzima
metahemoglobina reductasa reduce el Fe3+ de la metahemoglobina hacia Fe2+. La
metahemoglobina puede aumentar por oxidacin del Fe2+ a Fe3+ como un efecto secundario de
agentes como sulfonamidas, por hemoglobina M hereditaria, o como consecuencia de actividad
reducida de la enzima metahemoglobina reductasa.
PROTENAS Y EFECTORES ALOSTRICOS
La Hb es una protena alostrica; su afinidad por el O2 est regulada por molculas pequeas. La
actividad de estas protenas es modulada mediante la fijacin de pequeas molculas,
denominadas efectores alostricos (significa otros sitios o lugares). Estas molculas se fijan a
las protenas en lugares espacialmente distintos de los lugares de fijacin de los ligandos. A
travs de efectos conformacionales de largo alcance, alteran la afinidad de fijacin del ligando o
sustrato a la protena. Las protenas alostricas suelen estar formadas por varias subunidades. La
afinidad de fijacin de O2 por la Hb est influida positivamente por el O2, as como por diversos
efectores alostricos qumicamente diversos, como H+, C02 y 2,3-bisfos- foglicerato (2,3-BPG).
Cuando un efector alostrico afecta a su propia fijacin a la pro tena (en otros lugares), el
proceso se heterodmeros alfabeta se encuentra estabilizado por una combinacin de enlaces de
hidrgeno y electrostticos. En las interacciones no covalentes que caracterizan las
conformaciones desoxigenada y oxigenada de la Hb participan aproximadamente 30 aminocidos
EFECTO BOHR Y EFECTO HALDANE
El pH cido (protones) disminuye la afinidad de la Hb por el O2. La afinidad de la Hb por el O2 es
muy sensible al pH, un fenmeno conocido como efecto Bohr. La forma ms fcil de describirlo es
como un desplazamiento a la derecha de la curva de saturacin del O2 cuando disminuye el pH.
Por tanto, un aumento de la disminucin del pH favorece el aumento de P50 (menor afinidad)
para la fijacin del O2 a la Hb, lo que equivale a un desplazamiento dependiente de H+ de la Hb
del estado R al estado T.
La Hb es una molcula sumamente cargada; los residuos que participan en el efecto Bohr son el
grupo amino de la Val N-terminal de las cadenas a-globina y la cadena lateral de la His C-terminal
de la beta-globina. Los valores de pKa de estos cidos dbiles difieren lo suficiente entre las
formas desoxigenada y oxigenada de la Hb para hacer que la desoxigenada capte 1,2-2,4
protones, en comparacin con el tetrmero oxigenado. Una fijacin preferencial de un anin
concreto, por ejemplo Cl- y/o fosfatos orgnicos, a la Hb desoxigenada implica la alteracin de los
pK de algunos grupos catinicos, contribuyendo as al efecto Bohr observado en su conjunto.
Cuando la Hb fija O2, se disocian protones de algunos grupos cidos dbiles. En cambio, en un
medio cido, la protonacin de las bases conjugadas inhibe la fijacin de O2.
Durante su circulacin entre los alvolos pulmonares y los capilares de los tejidos perifricos, los
hemates se encuentran con unas condiciones muy distintas de pO2 y de pH. La elevada pO2
presente en el pulmn favorece la saturacin del ligando y fuerza a los protones de la molcula de
Hb a estabilizar el estado R, este efecto se conoce como efecto Haldane. En el lecho capilar,
especialmente en los tejidos metablicamente activos, el pH es ligeramente menor debido a la
produccin de metabolitos cidos, como lactato. Al entrar en este ambiente, la Hb oxigenada
adquiere algunos protones en exceso y pasa al estado T, favoreciendo as la liberacin de O2
para que sea captado para el metabolismo aerobio de los tejidos.
INFERENCIAS BIOMDICAS
Mioglobinuria
Despus de lesin por aplastamiento masivo, la mioglobina liberada a partir de fibras musculares
daadas tie la orina de color rojo oscuro. Es posible detectar mioglobina en plasma despus de
un infarto al miocardio, pero la valoracin de enzimas sricas proporciona un ndice ms sensible
de lesin miocrdica.
Anemias
Son reducciones del nmero de eritrocitos o de la hemoglobina en sangre y en ocasiones reflejan
sntesis alterada de hemoglobina (p. ej., en la deficiencia de hierro) o produccin alterada de
eritrocitos (p. ej., en la deficiencia de cido flico o de vitamina B12).
Talasemias
Son defectos genticos que se producen por la falta parcial o total de una o ms cadenas o
de la hemoglobina. Es posible que ocurra afeccin de la cadena (talasemia ) o la cadena
(talasemia ).
Hemoglobina glucosilada (Hba1c)
Cuando la glucosa sangunea entra a los eritrocitos, produce glucosilacin (glicacin) del grupo -
amino de residuos lisina y los amino terminales de la hemoglobina. La fraccin de hemoglobina
glucosilada, que por lo normal se ubica alrededor de 5%, es proporcional a la concentracin de
glucosa en la sangre.
Bibliografa

Murray R.K., Mayes P.A., Granner D.K., Rodwell V.W.: Harper Bioqumica Ilustrada.Manual
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