Está ubicada al noroccidente de Ecuador, en la provincia de Esmeraldas, entre La Tola, Borbón y el río Mataje.
Reserva Ecológica Mache – Chindul.
Está ubicado al suroccidente de Esmeraldas y al norte de Manabí, sobre la Cordillera Occidental.
Parque Nacional Machalilla.
Está ubicado al suroeste de la provincia de Manabí, en los cantones de Jipijapa, Puerto López y Montecristi.
Reserva Ecológica Manglares – Churute.
Está localizada en la margen occidental del estuario que el río Guayas forma cuando desemboca en el golfo de Guayaquil.
Región Sierra
Reserva Ecológica El Ángel
Está ubicada en la provincia de Carchi, en la región sierra norte, en las parroquias La Libertad y El Ángel del cantón Espejo.
Reserva Ecológica Cotacachi – Cayapas
Está ubicada al este de la provincia de Esmeraldas y al oeste de Imbabura.
Reserva Ecológica Cayambe – Coca
Está ubicada al Norte del Ecuador, en la parte central y norte del ramal Oriental de la Cordillera de los Andes, entre las provincias de Imbabura, Pichincha, Napo y Sucumbíos.
Reserva Ecológica del Antisana.
Está ubicada en la cordillera Oriental de los Andes, entre las provincias de Napo y Pichincha, y comprende los bosques andinos y páramos localizados en las planicies y estribaciones del volcán del mismo nombre.
Parque Nacional Sumaco-Napo-Galeras
Se encuentra al nororiente de Ecuador, entre las provincias de Napo y Orellana.
Reserva Geobotánica del Pululahua.
Está ubicada a 17 km al norte de Quito, cerca de La Mitad del Mundo en la Provincia de Pichincha
Refugio de Vida Silvestre Pasochoa.
Está ubicada en el cantón Mejía de la provincia de Pichincha, a 45 km al sudeste de Quito, cerca de la población de Amaguaña.
Parque Nacional Cotopaxi-El Boliche
Situada en el Cantón Latacunga en la Provincia de Cotopaxi. Parque Nacional Ilinizas. Está ubicada al occidente de la provincia de Cotopaxi y extremo sur de las provincias de Pichincha y Santo Domingo de los Tsáchilas.
Parque Nacional Llanganates
Situado entre las Provincias de Cotopaxi, Tungurahua, Pastaza y Napo.
Parque Nacional Sangay
Está ubicada entre las provincias de Morona Santiago, Chimborazo y Tungurahua.
Reserva de Bosque Chimborazo.
Se localiza en las provincias de Chimborazo, Bolívar y Tungurahua
Parque Nacional Cajas.
Está situado en los Andes, al sur del Ecuador, en la provincia de Azuay, a 33 km al noroccidente de la ciudad de Cuenca.
Parque Nacional Podocarpus.
Ubicado en las provincias de Loja y Zamora Chinchipe, en el sur oriente del Ecuador.
Bosque Petrificado Puyango
Situado en la cuenca media del río Puyango, entre las provincias de El Oro y Loja.
Región Amazónica
Reserva Forestal Cuyabeno.
Está ubicada en la provincia de Sucumbíos, en el noreste de la región Amazónica.
Reserva Biosfera Limoncocha
Está ubicada en el cantón Shushufindi de la provincia de Sucumbíos, en la región amazónica norte.
Parque Nacional Yasuní
Está ubicada entre las provincias de Pastaza, y Orellana entre el río Napo y el río Curaray en plena cuenca amazónica a unos 250 kilómetros al sureste de Quito.
Islas Galápagos
Parque Nacional Galápagos.
Las Islas Galápagos se encuentran ubicadas en el Pacífico Occidental, a 1 000 km al oeste de la costa ecuatoriana. Lo componen, 7 islas mayores: Isabela, Santa Cruz, Fernandina, Santiago, San Cristóbal, Floreana y Marchena; 14 islas menores: Española, Pinta, Baltra, Santa Fé, Pinzón, Genovesa, Rábida, Seymour Norte, Wolf, Tortuga, Bartolomé, Darwin, Daphne Mayor y Plaza Sur; 12 islas adicionales; 64 islotes y 136 rocas, todas de origen volcánico. Reserva Marina Galápagos Está ubicada a mil kilómetros del territorio continental de Ecuador y cubre un área de alrededor de 133.000 kilómetros cuadrados (51.000 millas cuadradas). Las Islas Galápagos y las aguas que las rodean representan uno de los ecosistemas más singulares del mundo y son áreas ricas en biodiversidad.