Professional Documents
Culture Documents
* Điều khiển hầu hết các phản ứng hóa học trong tế bào sống
(E. coli có 4288 protein, trong ®ã cã 2656 ®· ®îc x¸c ®Þnh c¸c
®Æc tÝnh vµ trong sè ®· x¸c ®Þnh ®ã cã 64% (1701) lµ
enzyme)
C¸c thuËt ng÷ vµ ®Þnh nghÜa enzyme
Biotin Carboxylation
Cobalamin (B12) Alkylation transfer
Coenzyme A Acyl transfers
Flavin Oxido-Reduction
Lipoic acid Acyl transfers
Nicotinamide Oxido-Reduction
Pyridoxal phosphate Amino group transfers
Tetrahydrofolate One carbon group
transfers
Thiamine pyrophosphate Aldehyde transfer
Vitamin B complex coenzymes
Copyright © 2004 Pearson Education, Inc., publishing as Benjamin Cummings Figure 5.8
C¸c thuËt ng÷ vµ ®Þnh nghÜa enzyme
ChÊt øc chÕ kh«ng c¹nh tranh (Noncompetitive inhibitor):
bÊt kú chÊt nµo mµ liªn kÕt víi mét phÇn cña enzyme ngoµi
trung t©m ho¹t ®éng mµ øc chÕ ho¹t tÝnh cña enzyme.
TÝnh hoat ®éng cña enzyme (Enzyme Activity) lµ mét sù
®o vËn tèc cña ph¶n øng t¨ng lªn bao nhiªu khi cã sù hiÖn
diÖn cña enzyme.
§Þnh nghÜa tÝnh ho¹t ®éng cña enzyme
Nã lµm t¨ng tèc ®é cña ph¶n øng lªn ®Õn hµng 1000
lÇn
b- Đặc trưng cấu tạo (group): enzyme đặc trưng với các
nhóm (groups) hoặc các nguyên tử xung quang liên kết.Do
vậy nó sẽ hoạt động nên nhóm nhỏ của cơ chất related
substrates e.g.
•Trypsin đặc trưng với liết kết peptide có carboxyl group
của các amino acid bazơ nhưng không đặc trưng với amino
acids ở phía khác của liên kết.
•Chemotrypsin đặc trưng với liên kết peptide có carboxyl
group của amino acid thơm.
Tính đặc trưng
* Enzyme nhận biết chọn lọc cơ chất riêng
* Tính đặc trưng được kiểm soát bởi cấu tạo –
enzyme kiểm soát tính chọn lọc cơ chất và sản
phẩm.
Enzyme liên quan tới kiểu cơ chất
Enzyme có tính đặc trưng cao đối với loại phản ứng xúc tác,
nhưng nó không phải lúc nào cũng đúng với cơ chất mà chúng
xúc tác
Khi cơ chất liên kết với enzyme, enzyme xúc tác chuyển
đổi cơ chất thành sản phẩm.
– Sucrase là enzyme liên kết với sucrose và phá vỡ
disaccharide thành fructose và glucose.
c- Tính đặc trưng tương đối: là đặc trưng với liên kết, vì
vậy mà enzyme hoạt động nên các cơ chất lớn e.g. lipase,
dipeptidase (đặc trưng với liên kết peptide giữa 2 amino
bất kỳ).
Turnover number:
Số phân tử cơ chất chuyển đổi thành sản phẩm trên
một phân tử enzyme trên giây.
1.5 §Þnh danh enzyme
Mét sè tªn gäi enzyme kh«ng liªn quan g× tíi viÖc
h×nh thµnh ph¶n øng xóc t¸c, eg. catalase, trypsin,
papain….
IUBMB (International Union of Biochemistry vµ
Molecular Biology) ®îc thµnh lËp vµo n¨m 1955
CÁCH ĐẶT TÊN ENZYME:
1-Thêm đuôi “ase” sau tên cơ chất. e.g lactase, arginase. Thủy
phân lactose và arginine.
2- Thêm hoạt động của enzyme vào tên cơ chất, e.g malate
dehydrogenase (loại hidro từ malate), glutathione reductase
(khử glutathione).
3- Một số enzyme còn giữ tên cũ, e.g pepsin, trypsin. etc.
PHÂN LOẠI ENZYME
Enzyme có thể phân loại theo các phản ứng
hóa học mà nó xúc tác
1) Bổ sung oxygen:
a.Mono-oxygenase (bổ sung 1 nguyên tử oxy)
b.Di-oxygenase (bổ sung 2 nguyên tử oxy)
2) Loại bỏ hydro :
Dehydrogenase (cần coenzyme để mang hydro)
XH2 + A→ X + AH2 ↑ ↑(coenzyme as FAD,NAD)
-Oxidases: amino acid oxidase, catalase
-Peroxidases:use H2O2 as electron acceptor
2.1 ChuyÓn mét nhãm carbon
2.3 Acyltransferase
2. Transferase
2.4 Glycosyltransferase
(VËn chuyÓn nhãm)
2.6.1 Transaminase
2.7 ChuyÓn nhãm chøa photpho
2.7.1 Nhãm alcohol nhchÊt nhËn
2. Transferase
Carboxylase
Pyruvic Oxaloacetic
Pyruvate carboxylase
Synthetase
Glutamic Glutamine
Glutamine synthetase
5.1 Racemase vµ epimerase
5. Isomerase 5.3 Oxidorductase gi÷a ph©n tö
5.4 Transferase gi÷a ph©n tö
1. Oxidoreductase... [dehydrogenase]
Xóc t¸c c¸c ph¶n øng «xy ho¸ khö, thêng sö dông
coenzyme nhNAD+/FAD
• Alcohol dehydrogenase [EC 1.1.1.1]
ethanol + NAD+ -------> acetaldehyde + NADH
2. Transferase....
Xóc t¸c chuyÓn ®æi c¸c nhãm chøc n¨ng
• Hexokinase [EC 2.7.1.2]
D-glu + ATP ----------> D-glu-6-P + ADP
3. Hydrolase .…
Xóc t¸c c¸c ph¶n øng thuû ph©n bæ sung níc vµo c¸c liªm
kÕt chÐo C-C
• Carboxypeptidase A [EC 3.4.17.1]
[aa-aa]n + H2O ----> [aa-aa] n-1 + aa
4. Lyase ....
Bæ sung hoÆc lo¹i bá c¸c nhãm vµo liªn kÕt C=C
• Pyruvate decarboxylase [EC 4.1.1.1]
pyruvate -----> acetaldehyde + CO2
5. Isomerase… [mutase]
Xóc t¸c ®ång ph©n ho¸ (isomerization)
6. Ligase…
KÕt hîp 2 c¬ chÊt cã ph©n huû ATP
1-Nồng độ cơ chất:
Tốc độ của phản ứng phụ thuộc vào nồng độ cơ chất.
•ở nồng độ cơ chất cao, thì tốc độ tăng tăng chậm hoặc không
tăng.
Km = affinity of substrate for enzyme; defined as
[substrate] that elicits half-maximal reaction velocity
Km
Factors Influencing Enzyme Activity
• Substrate concentration
Copyright © 2004 Pearson Education, Inc., publishing as Benjamin Cummings Figure 5.5c
Nồng độ enzyme
Copyright © 2004 Pearson Education, Inc., publishing as Benjamin Cummings Figure 5.6
Factors Influencing Enzyme Activity
• pH
Copyright © 2004 Pearson Education, Inc., publishing as Benjamin Cummings Figure 5.5b
C¸ c enzyme ph¶n øng ví i pH nh thÕnµo
1.2
1
Relative activity (-)
Complete stability
0.8
0.6
1- ảnh hưởng của pH nên quá trình ion hóa trung tâm xúc tác:
Nồng độ H+ ảnh hưởng đến tốc độ phản ứng theo một số cách.
Quá trình xúc tác thường đòi hỏi enzyme và cơ chất có các
nhóm hóa học đặc trưng ở trạng thái ion hóa hoặc không để mà
tương tác.
VD: tính xúc tác cần nhóm amino của enzyme ở dạng proton (-
NH3+). Ở pH kiềm nhóm này bị khử proton và tốc độ phản
ứng châm lại.
Ảnh hưởng của pH nên sự biến tính của
enzyme
pH quá cao hoặc quá thấp có thể dẫn tới sự
biến tính của enzyme, bởi vì cấu trúc của
trung tâm xúc tác của phân tử protein phụ
thuộc vào tính chất ion của các amino acid
chuỗi cạnh
Overcoming pH inactivation
Relative enzyme activity [-]
pH
The pH dependence of 2 enzyme catalysed reactions is
shown, a base producing enzyme (a) and an acid
producing enzyme (b). The pH setpoint can be chosen
by changing relative amounts of both enzymes.
Catalytic buffers in detection of
nerve agents
Choline
Butyryl choline + H 2 O Butyric acid +
Esterase
Choline
2.5
• D ynam ic pH p H e qu ilibrium
equilibrium
– Cholinesterase 1.5
• Produces butyric acid
• pH optim um at ~8.0 1
Urease ChE
– Urease 0.5
• Produces NH 4 + and O H -
0
• pH optim um below 7
5 6 7 8 9 10
pH
Response Choline
Esterase
Butyryl choline + H2O Butyric acid + Choline
10
UN SAFE
8
pH 6
4
SAFE
2
Time
pH indicator reports colour change: low pH green, high pH red.
pH tối ưu của enzyme khác nhau
ở pH này thì hoạt tính của enzyme đạt được tới mức tối
đa.
Copyright © 2004 Pearson Education, Inc., publishing as Benjamin Cummings Figure 5.5a
Temperature
Các chất ức chế không phục hồi được thường đựơc cho
là các chất độc rất khó cứu chữa.
B- Các chất ức chế phục hồi được
Copyright © 2004 Pearson Education, Inc., publishing as Benjamin Cummings Figure 5.7a, b
Factors Influencing Enzyme Activity
Copyright © 2004 Pearson Education, Inc., publishing as Benjamin Cummings Figure 5.7a, c
1- Các chất ức chế cạnh tranh
Chất ức chế cạnh tranh với trung tâm xúc tác của
enzyme.
-Vmax: không thay đổi
-Km: tăng lên
Một số enzyme có chức năng điều hòa đặc trưng đáp ứng
hiệu ứng allosteric hoặc thay đổi hóa trị, hoặc thay đổi tốc
độ tổng hợp của enzyme khi các điều kiện sin lý thay đổi.
A. Vị trí liên kết Allosteric
1. Phosphorylation và dephosphorylation:
Phản ứng Phosphorylation được xúc tác bởi họ enzyme,
gọi là protein kinases, sử dụng adenosine triphosphate
như là chất cho phosphate.
Gốc Phosphate được phân hủy từ enzyme đã phospho
hóa nhờ hoạt động của phosphoprotein phosphatase.
2. Phản hồi của enzyme với quá trình phospho hóa: phụ
thuộc vào enzyme đặc trưng, dạng phospho hóa có thể
hoạt động nhiều hoặc ít hơn enzyme không phospho hóa.
VD, quá trình phospho hóa của glycogen phosphorylase
(enzyme phân hủy glycogen) tăng hoạt tính, mà nó bổ
sung phosphate vào glycogen synthase (enzyme tỏng hợp
glycogen) giảm hoạt tính.
C. Kích thích và kìm hãm sinh tổng hợp enzyme
Các enzyme cần điều hòa quá trình tổng hợp thường cần
thiết cho chỉ một công đoạn của sự phát triển hoặc dưới
các điều kiện sinh lý chọn lọc.
VD, tăng mức insulin do lượng glucose trong máu cao gây
ra tăng sinh tổng hợp những enzyme chính liên quan tới
đồng hóa glucose. Ngược lại, các enzyme sử dụng không
đổi thường không được điều hòa bởi sự sự thay đổi tốc độ
sinh tổng hợp enzyme.
Factors Influencing Enzyme Activity
• Feedback
inhibition
Copyright © 2004 Pearson Education, Inc., publishing as Benjamin Cummings Figure 5.8